建康太学位于建康（今南京）鸡笼山下，始建于东晋建武元年（317年），后历经南朝宋、齐、梁、陈建康太学绵延不断。

西晋咸宁四年（278年）初立国子学，这是中国古代教育史上在太学之外另立国子学之始。《晋书·卷二十四·职官志》记载：“咸宁四年，武帝初立国子学，定置国子祭酒、博士各一人，助教十五人以教生徒。博士皆取履行清淳，通明典义者，若散骑常侍、中书侍郎、太子中庶子以上，乃得召试。”国子学限五品官以上贵族子弟方可入学。但国子学在西晋并不景气，尤其是西晋末年以后，时兴时废。

晋武帝司马炎统一全国之后，建业太学中断。

晋武帝死后，中原“八王之乱”，以王导、谢安为首的大族，于西晋永嘉元年（307年）簇拥着西晋皇族琅邪王司马睿，仓促南渡至建邺（史称“永嘉南渡”）。

西晋永嘉七年（313年），因为晋愍帝的名字叫司马邺，为了避他的名讳，又把建邺县改称建康县。

东晋建武元年（317年）晋元帝司马睿于建康（今南京）设太学，后历经南朝宋、齐、梁、陈建康太学绵延不断。

刘宋元嘉十五年（438年），宋文帝召雷次宗至京师，令国子学开馆于鸡笼山，聚徒百人教授。

刘宋末年，祖冲之回到建康（今南京），担任谒者仆射的官职祖。

祖冲之花了较大的精力来研究机械制造，重造指南车，发明千里船、水碓磨等等，是中国机械工程专业之最早肇始。祖冲之算出圆周率的真值在3.1415926和3.1415927之间，相当于精确到小数第7位，简化成3.1415926，成为当时世界上最先进的成就。