广西业嘉足球俱乐部由广西业嘉投资集团出资组建。俱乐部前身是防城港市业余体校足球队，后更名防城港市港宁足球队。自2012年开始参加广西足球超级联赛（桂超联赛），并先后使用过防城港业嘉建设港宁足球俱乐部（2012年）、广西业嘉建设足球俱乐部（2013年）等名称，2015年9月11日，在工商部门注册成立“广西业嘉足球俱乐部有限公司”。2016年俱乐部因不满判罚退出桂超联赛，2019年更名防城港市足球俱乐部再次参加桂超联赛。

1998年10月，以防城港市业余体校83、84年龄段球员为班底组建防城港市第九届区运会足球队，先后获得广西壮族自治区青少年足球锦标赛（甲组）亚军和广西壮族自治区第九届运动会第7名。

后来，以该队为班底组建了防城港市（防城区）港宁足球队。

2012年开始以防城港业嘉建设港宁足球俱乐部参加广西足球超级联赛。2013年更名广西业嘉建设（港宁）足球俱乐部。2015年9月11日，在工商部门注册成立广西业嘉足球俱乐部。

2016年，广西业嘉足球俱乐部因不满判罚退出广西足球超级联赛。

2019年，俱乐部更名为防城港市足球俱乐部（董事长禤达升），再次参加广西足球超级联赛。