山东省土壤肥料总站承担全省土壤普查和土壤改良的指导任务；拟订种植规划和改革耕作制度；推广应用新技术；提供技术信息服务。

山东省土壤肥料总站成立于1980年，是山东省农业厅直属处级全额事业单位，内部设置综合科、土壤科、节水科、肥料科、肥料登记办公室、稽查科、质量管理科和检测科，农业部肥料质量监督检验测试中心（济南）。编制32人，现有在职职工27人。其中具有高级专业技术职务的9人、副高级专业技术职务的5人、中级专业技术职务的8人。土肥总站负责编制全省土壤、肥料、节水农业发展规划。开展全省土壤及耕地资源调查评价及利用工作。负责全省耕地质量建设、肥料登记管理。开展土壤、肥料、植株等检测工作。负责耕地培肥与改良、科学施肥、农田节水等土肥水技术试验、示范与推广工作。负责全省土肥系统业务指导和技术培训工作。

共设八个科：综合科、土壤科、节水科、肥料科、质量管理科、检测科、肥料登记办公室、稽查科。各科具体职能如下。

综合科

协助站长做好站务管理工作，负责拟定综合文稿及公文工作；负责印鉴管理、财务工作；负责后勤、安全、接待、文件收发及档案管理、车辆、老干部、政工等工作；负责土肥信息网的网站维护及信息收集与反馈工作；负责站务会议和全省性工作会议等会务工作；负责领导交办的其它工作。

土壤科

负责编制全省土壤培肥、改良和利用规划；负责土壤与耕地资源调查与评价、土壤培肥和改良、基本农田质量保护、有机肥及秸秆还田技术推广与研究；负责全省土壤方面新技术的推广与管理；完成领导交办的其它工作。

节水科

负责编制全省节水农业技术发展规划；编制节水农业技术标准和技术规程；引进、集成、示范和推广节水农业技术及培训与指导；负责全省土壤墒情监测网络的建设与管理；开展技术服务、咨询等活动。

肥料科

负责编制肥料需求规划和全省施肥区划；负责科学施肥技术的推广应用，掌握肥料施用动态；肥料供求动态信息；负责新型肥料的试验、示范和推广；负责肥料面源污染相关工作；完成领导交办的其它工作。

质量管理科

负责编制全省土壤肥料测试化验体系、土壤肥料质量检测网络体系建设规划；负责全省耕地肥力监测；负责肥料产品的监督抽查；负责质量手册中规定业务室的有关工作及领导交办的其它工作。

检测科

负责编制全省土壤肥料质量检验技术操作规程；组织研究和推广应用新的土壤肥料测试化验方法；负责引进、试验和推广新的分析化验技术及技术培训；负责编制有关实验室分析化验技术规范和技术标准；承担土壤、肥料等质量监督检验任务；负责手册中规定检测室的有关工作及领导交办的其它工作。

肥料登记办公室

负责肥料登记工作。受理属省级肥料登记产品的登记申请及资料审核，登记资料的整理建档，登记证发放及“山东省肥料登记评审委员会”的日常事务等工作；负责登记肥料产品的田间肥效试验、示范，报农业部登记申请资料的初审推荐等。

稽查科

负责肥料市场的监督管理。根据国家法律法规授权或省农业厅委托制定全省肥料市场打假方案并组织实施；指导基层执法工作，受理肥料质量投诉，依法查处假冒伪劣肥料产品案件。