屯田清吏司是明清时期工部下设的机构。

屯田清吏司设郎中 5人（满 4人，汉 1人），员外郎 6人（满 5人、汉 1人）、 主事 5人（宗室 1人，满、汉各 2人）、笔帖式若干人，经承 8人。司下设都吏、准支、柜、杂、匠五科和案房、算房、火房，分办本司事务。屯田司掌陵寝修缮及核销经费、支领物料；主管四司工匠定额及钱粮等事；管理各地开采煤窑及供应官用薪炭。