小麦国家工程实验室是2011年5月，国家发展改革委批准了小麦国家工程实验室（郑州）项目资金申请报告。该项目在现有基础上，建立分子标记、基因克隆、新品种选育与评价、高产高效栽培等技术研发平台及品种示范基地。

项目主要建设地点为河南省郑州市。

国家发改委批准以河南省农业科学院为依托建设小麦国家工程实验室，这是河南省首个粮食作物遗传育种类国家工程实验室。

著名小麦专家、省农科院小麦研究中心主任许为钢任小麦国家工程实验室主任，据他介绍，该实验室建设省农科院小麦研究中心为主体，共建设9个专业研究室，中国作物科学研究所和中科院遗传与发育研究所承担部分实验室建设工作，并在黄淮海南部区域设立若干个育种站。

在未来3至5年，该实验室将重点解决当前小麦研究中广适性超高产品种少、育种速度慢等问题，克隆具有重要育种利用价值的基因20个以上，开发与重要性状基因紧密相关的分子标记100个，选育具有自主知识产权的小麦新品种30个左右，形成支撑小麦平均单产提高5%以上的技术能力，为黄淮海麦区小麦增产提供技术支撑。