2000年9月1日,学院路、成府路、万泉河路三条繁华街道的小公共汽车率先撤出。9月25日,小公共汽车撤出包括长安街及其延长线在内的五条重要道路。由此,北京小公共开始撤出城区繁华路段。
2001年1月1日,北京市重新招标规划线路后开通的第一辆小公共——小3路驶上新旅程。5月18日结束的市十一届人大常委会第26次会议上,《
北京市小公共汽车管理条例》获得通过。12月1日,在三环路运营的302、300、323路等800多辆小公共汽车停止运营。12月15日,
北京市所有小公共汽车临时线路全部取消,最后的1600辆小公共也转到不通公交车的小区或郊区运营。取而代之的是经过统一规划和招标后开通的79条小公共线路。