明永乐初年（1403）充郡
庠生，上书朝廷言时事，升补太学生。曾偕同
宦官勘山东军需钱粮，用三年时间清理了积弊。宣德初年（1426）擢升为刑部主事，迁
员外郎。他善于审断疑狱，有“神明”之称。正统九年（1444）授山西按察司副使。当时天久不下雨，录所属地方重囚有疑点的50余人上奏释放，又上边务几十件，多被采纳。正统十一年（1446）入朝拜都察院右佥都御史，巡抚四川，讨松番的割据武装，接受命令马上行动，不到一个月就到了那里，他申明军纪，练兵制械，筑关堡城池64所，哨台370多座，进攻割据武装的营寨，擒获其头领，送至京城处斩，降伏了地方割据武装，使其主动献出盔甲刀剑3000多件，良马400多匹。升
左副都御史。以母亲年老上书请求归养，没得到批准。不久命他提督辽东军务，那些权贵和武臣在他面前都表现得很规矩。
景泰四年（1453），李福在海上起事，寇深遣都指挥周英捕获千余人，寇深只让囚其首领20余人送到京城，其余人一律释放。景泰五年（1454），蒙古部落内侵，寇深领军作战，斩获敌兵70余人，马600多匹。又上奏请求回家养老母，又没得到允准。景泰七年（1456）召入朝议事。母亲去世后又夺情起用。他再三上疏请辞，天顺改元后才获得批准。后再起用为左都御史，率台臣弹劾
曹钦骄纵不法之事。天顺四年（1460）七月二日，曹钦图谋不轨，密遣其党羽把寇深害死于朝房。赠少保，谥“壮愍”。