家畜真菌病是由病原性真菌在畜、禽中引起的疾病的总称。世界性分布。中国也经常发生。真菌种类繁多，但对人类和动物致病的则还不到50种，有10多种能引起致死性感染。真菌病属于传染病范畴。但由非病原性真菌产生的毒素所引起的真菌中毒病，则不属传染病范畴。如一些中毒性真菌在饲料或饲草中营腐生或寄生生活，所产生的毒性代谢产物或毒素被动物摄食后可引起急性或慢性中毒，但无传染性。

由病原性真菌（见兽医微生物学）引起的家畜真菌病可分为3类： ①体表真菌病。病变发生于皮肤和粘膜，多为浅表性和局限性。在真菌病中占的比例较大。病原主要来自半知菌纲(Deuteromycetes)中的4个属:小孢子菌属(Microsporum)、 毛癣菌属(Trichophyton)、念珠菌属(Candida)和孢子丝菌属(Sporothrix)。 其中小孢子菌和毛癣菌俗称皮肤真菌，生长于羽毛、毛发、趾甲、皮肤，可使被寄生的宿主产生多种疾病，统称皮肤真菌病，俗称钱癣或轮癣。人畜之间可通过接触而互相传染。②体内真菌病。病变主要发生于动物机体的深层结构和器官，但也有侵害皮肤的。除少数病例的病变呈局限性以外,呈泛发性乃至播散性。病原主要分布于下列4个属：曲霉菌属(Aspergillus)、类球虫霉属(Coccidioides)、隐球菌属(Cryptococcus)和组织胞浆菌属 (Histoplasma)。曲霉菌属中的黄曲霉 (Aspergillus flavus)能在畜禽中引起急性和慢性真菌毒素中毒，称为黄曲霉中毒；烟曲霉 (A.fumigatus)则能在各种畜禽中引起一系列的真菌病,称为曲霉病,包括幼鸡的霉菌性肺炎和牛的流产、乳腺炎和瘤胃炎等。由组织胞浆菌属中的皮疽组织胞浆菌(Histoplasma farciminosum)引起的马、骡流行性淋巴管炎，是很早就流行于很多国家的一种慢性传染病，主要经过损伤的皮肤或粘膜而感染，以皮下淋巴管发生化脓性炎症、形成结节和溃疡为特征。病变多发生于四肢、颈、胸侧等处，组织胞浆菌即存在于脓汁中。在临诊上很易与鼻疽（皮疽）相混淆。③其他真菌病。包括：霉菌性流产，由胎盘受真菌感染而致，常见于牛，马及绵羊也有发生。霉菌性乳腺炎，通常因乳房内注射受真菌污染的抗生素制剂而引起，多见于奶牛和山羊。霉菌性瘤胃炎，发生于长期饲喂抗生素的犊牛，因瘤胃内的正常细菌菌丛受抑制，利于真菌繁殖而致病。霉菌性角膜炎由角膜受损伤后真菌侵入而引起，受感染的角膜发生混浊和溃疡。

本病一般可根据流行病学资料、临诊症状和剖检病变作出初步诊断。确诊需进行实验室诊断。体表真菌病常作病料或病变组织的显微镜检查、病原分离培养和动物试验。体内真菌病需进行血清学诊断，如补体结合、荧光抗体、琼脂凝胶扩散等试验。有些真菌病如流行性淋巴管炎和孢子丝菌病等还可进行变态反应试验。

注意环境和畜体清洁卫生，改善通风条件，避免拥挤、潮湿和防止伤口感染，是主要的预防措施。多数真菌病的康复动物对再感染具有免疫力，有些病的疫苗已研究成功，有些正在取得进展。治疗用的特效药物有灰黄霉素、制霉菌素、 两性霉素B等。有些真菌病可施行局部外科手术，如流行性淋巴管炎。