实质性行政违法又称实体上的行政违法，是指行政主体的行为在内容上违反了行政法律规范的实质性要件。

(1)行政主体不合法；

(2)行为超出了行为主体的法定权限；

(3)意思表示不真实；

(4)行为的内容同行政法律规范所规定的目的、原则和规则相悖。

区分实质性行政违法与形式性行政违法具有重要的法律意义：首先，从法律效力看，实质违法一般属无效行为，从该行为发生之时即没有法律效力，而形式违法一般属可撤销行为，它经有效补救可转化为有效行为；其次，从法律后果看，实质违法所引起的法律后果主要是承担惩罚性行政责任(如行政处罚、行政处分)，而形式违法所引起的法律后果主要是承担补救性行政责任(如撤销违法)。