1980年，主演个人首部电影《
十八岁未嫁时》。1993年，执导个人首部电影《爱情故事通常结局不幸》。1997年，自编自导剧情电影《干洗》，该片入围第54届威尼斯电影节主竞赛单元，她凭借该片获得第54届威尼斯电影节金奥赛拉奖-最佳编剧奖。
2001年，执导由米歇尔·布凯、夏尔·贝尔林、
娜塔莎·雷尼埃联合主演的惊悚电影《我如何杀死了父亲》，该片入围第54届洛迦诺国际电影节金豹奖。2003年，执导由
芬妮·阿尔丹、
艾曼纽·贝阿、
杰拉尔·德帕迪约联袂主演的剧情电影《
娜塔莉》。2005年，由其自编自导的剧情电影《
红杏惊魂》上映，该片入围第31届法国凯撒奖最佳改编剧本奖。
2008年，由其执导的喜剧电影《
摩纳哥女孩》上映，该片由
法布莱斯·鲁奇尼、
罗什迪·泽姆、斯特凡·奥德朗联合主演。2009年，自编自导传记电影《
时尚先锋香奈儿》，该片入围第63届英国电影和电视艺术学院奖电影奖非英语片奖、第35届法国凯撒奖最佳改编剧本奖。
2011年，执导由
伊莎贝尔·于佩尔、伯努瓦·波尔沃德共同主演的爱情喜剧电影《
我最糟糕的噩梦》。2013年，执导由
娜奥米·沃茨、
罗宾·怀特合作主演的剧情电影《
忘年恋曲》，该片讲述了两个母亲分别与对方的儿子产生了忘年恋情。2014年，由其执导的剧情电影《
新包法利夫人》上映。
2016年，自编自导由
费尼肯·欧菲尔德、
格莱高利·嘉德波瓦共同主演的剧情电影《
无辜者》，她凭借该片获得第42届法国凯撒奖最佳导演奖，该片入围第42届法国凯撒奖最佳影片奖、最佳原创剧本奖。2017年，执导由费尼肯·欧菲尔德主演的剧情电影《
重塑马文》，该片讲述了马文和马丁两人，经历了磨难最终成才的故事，入围第74届威尼斯电影节地平线单元奖-最佳电影奖。
作为一位驰骋影坛多年的后起之秀，安妮·芳婷以其极富“作者”气质的个性色彩和独特的镜头魅力，堪称法国女导演中的翘楚。她执导的作品有些锐利，有些残酷，却很难被归类。她偏爱婚姻题材，尤其喜欢构筑和探究伦理与欲望之间的微妙窘境，但她也始终坚持以清醒的头脑为角色谋寻出路。芳婷的作品常常被冠以“心理片”之名，而她对生活细致的观察和独到的洞悉，也使其无愧于一名崛起于世纪之交的“作者导演”。在电影《红杏惊魂》中，安妮·芳婷将爱情、心理、悬疑和惊悚融于一炉，为观众上演了一场剃刀狂魔式的惊悚伦理片（《大众电影》评）。