《妙法莲华经玄义》内容分两部分。一为“七番共解”，通释“五重玄义”。七番是：一标章、二引证、三生起、四开合、五料简、六观心、七会异。二为正说“五重玄义”。“五重玄义”即释名、辨体、明宗、论用、判教。在“释名”中，先释“法”，广明众生法、佛法、心法；次释“妙”，先通释“相待”、“绝待”二种妙，再别释“本门”、“迹门”各十种妙；最后释“莲华”和“经”。在“辨体”中，阐明《法华经》以实相为体，如如、涅槃、佛性、中道、第一义谛等皆是实相之异名。在“明宗”中，指出《法华经》以佛自行因果为宗，或以合师弟因果为宗。在“论用”中，论说《法华经》以断疑生信为用。在“判教”中，先批判“南三北七”之说，进而自立“
五时八教”的判教说。书末附灌顶所作《记者私录异同》一文。此书是天台宗的重要著作，为“
天台三大部”之一。历来注释节略之书很多，著名的有：唐湛然的《
法华玄义释签》、宋法照的《法华经玄义读教记》、宋从义的《法华玄义补注》、明传灯的《法华经玄义辑略》、明智旭的《法华经玄义节要》等。此书见载于历代大藏经。