忠县太保祠位于忠县城西4千米处的秦家坝，清末所建，原为明末女将军秦良玉旧宅。

秦良玉（1584—1648年）乃忠州（今忠县）人，石柱宣抚使马千乘妻。马死后，秦代夫职，所领部队号“白杆兵”。曾参加镇压杨应龙、奢崇明土司叛乱，抗击张献忠入川。后接受南明封号抗清。因讨奢崇明有功，授都督佥事，后任总兵官，南平蜀乱，北抗清兵。因功高德重赐诰命夫人，加太子太保，封忠贞侯。

现太保祠主殿犹存，大门基本维持原样。

1945年农历七月初二日，国民政府最高领导人蒋介石来忠县，在参观蜀汉壮烈将军严颜故里后，曾打听去巴蔓子和秦良玉太保祠的道路，因被告之较远，最后没去，可见蒋介石对巴曼子以及严颜秦良玉等也是极敬重的。

原来是秦良玉大都督府。位于石柱县城狮子坝，原名土司署，始建于明朝洪武初年，初为石柱宣抚司、宣慰司署，明末，秦良玉因功被崇祯朝封为中军都督府左都督，遂改名为秦良玉“大都督府”。

清乾隆三十九年（公元1774年），石砫直隶厅同知王萦绪奉乾隆皇帝圣谕改建为太保祠。

嘉庆初年，朝廷降旨将其纳入国家祀典，由地方官春秋致祭。大都督府共占地20000平方米，建有门坊、正殿、寝殿、后堂、玉音楼、柏子堂、坐隐楼、宾月楼、芹香亭和殿堂亭榭等建筑。府门悬挂“大都督府”匾额，门联书“汉室将军甲第，明朝都督人家”，正殿悬挂“忠义可嘉”匾。四周树立着文人墨客题咏碑刻。玉音楼有五楹三层，正檐下挂“龙章四宝”匾额。

民国二十二年（公元1933年）废除了祭祀，存于大都督府内的秦良玉战袍、象牙朝笏、“太子太保总镇关防”印均一度损失（后来赎回），古器被变卖一空。

民国三十五年（公元1946年）十月，四川省政府决定太保祠由政府接收管理。

新中国成立后，于六、七十年代爆发了“文革”，在此期间，“红小兵”给秦良玉扣上了“土司婆娘”这个称号，说她出身“反动”，胆敢抵抗张献忠“农民起义军”，十恶不赦。捣毁了秦良玉的墓，并且将秦良玉大都督府房屋全部拆毁，而后改建为县水电局、二轻局、广播局。

现在又开始进行重建工作！

太保祠位于重庆市忠县城西4千米处的秦家坝，从重庆市区到万州，既可乘船，也可乘长途汽车。每天往返于两地间的车船有很多班次。万州至周边地区各景点多数通有汽车。