已有的研究表明大豆脂肪氧化酶同功酶随植株发育而产生较大变化，在幼嫩快速生长的组织中通常都表现出很高的酶活性，且在某些发育阶段中会产生新的大豆脂肪氧化酶同功酶。这促使相当一部分研究者认为大豆脂肪氧化酶在植物组织的生长和 (或 )发育中起某种作用。 有些研究者认为大豆脂肪氧化酶在萌发种子中的高活性加速了细胞膜的瓦解，从而有利于贮藏的营养物质向正在发育的胚中转移。 另一方面研究认为脂肪氧化酶在种子萌发的早期阶段可能参与调节或触发细胞内各种各样的过程，而不是主要参与不饱和脂肪酸的呼吸作用或活动化作用；他们同时认为细胞中的脂肪氧化酶是在贮藏组织中的贮藏物开始活动化作用和某些组织中叶绿体开始生物合成时才发挥功能。研究者认为在正在发育的芽尖中大豆脂肪氧化酶可能起到作为氨基酸暂时贮藏场所的重要作用。但大豆脂肪氧化酶在生长发育中的作用还远不清楚，尚须深入研究。
大豆叶片中，总有脂肪氧化酶存在但与反应底物是分开的，直到受到伤害或产生组织损伤，脂肪氧化酶方能与底物产生接触。认为脂肪氧化酶在伤害反应和抗有害生物中起作用是缘于研究发现植物组织受到伤害后，脂肪氧化酶蛋白质及其活性会急剧增加，并会形成新的脂肪氧化酶同功酶。大豆脂肪氧化酶的直接抗性反应就是催化亚麻酸和
亚油酸氧化生成脂质过氧羟自由基和一些次级氧化产物，这些物质对有害生物是有毒性的，许多研究表明脂肪氧化酶催化产物如己醛等对植物病原物有着不利的影响，研究证实氢过氧化物和己醛对害虫有驱除作用。 同样许多研究者也指出受到伤害后的初期阶段，抗性品种比易感品种脂肪氧化酶的活性要大得多。
分光光度法对大豆中三种脂肪氧化酶(同工酶)进行检测并测定脂肪氧化酶活性，研究表明：大豆粉碎后随着贮存时间的延长，脂肪氧化酶活性逐渐降低，大豆发芽后脂肪氧化酶活性降低了43%。
现日本等国已选育出大豆种子单缺失、双缺失和三缺失品系，可为大豆加工提供优质原料。利用大豆脂肪氧化酶的氧化作用，能对面粉进行漂白，研究开发天然安全面粉漂白剂。因此无论是大豆品种选育，还是在大豆产品加工利用、深度开发等方面，进行大豆脂肪氧化酶活性测定以及变化规律分析研究具有重要的意义。