增值税防伪税控系统是国家为加强增值税的征收管理，及时发现和查处增值税偷骗税行为而实施的国家金税工程的主要组成部分。

该系统是1994年由国家税务总局与航天工业总公司等部门，组织力量，联合攻关，集计算机、微电子、光电技术和数据加密等技术于一体开发研制的。该系统采用复合式加密认证算法，采用理论上不可破译的一机一密，一次一密的密码体制，具有很强的保密性和安全性。税务部门和企业利用该系统能独立实现发票的防伪认证，不需联网即可随时随地稽查假发票和大头小尾的“阴阳”票。同时，从该系统的报税子系统取得的存根联数据和认证子系统取得的抵扣联数据将直接进入增值税计算机稽核系统，通过增值税计算机稽核系统，对增值税专用发票信息和纳税申报信息进行全面的交叉比对，及时掌握税源情况和发现增值税税收管理过程中的各种问题，能够遏制利用增值税专用发票违法犯罪行为。

防伪税控系统由四个子系统构成：税务发行子系统、企业发行子系统、防伪开票子系统和认证报税子系统（认证和报税为二套软件，但必须装在同一台计算机中）。税务发行子系统的主要功能是对下级税务发行子系统、下级企业发行子系统及下级认证报税子系统进行发行；企业发行子系统的功能是对企业开票子系统进行初始发行和向企业发售专用发票；认证报税子系统的主要功能是接收企业的抄税数据并对发票的真伪进行辨别，以上三个子系统是分别用于各级税务机关。防伪开票子系统则是专门用于企业开具专用发票，防伪税控开票子系统必须通过其主管防伪税控税务机关对其所持有的“税控IC卡和金税卡”进行发行后才能使用。