堂邑县是南京在秦朝至隋朝时期的一个县，故址在今南京市六合区一带。

春秋战国时期，棠邑先属楚，后属吴，再属越，至公元前334年复归于楚，为吴楚交界吴国的重镇。

秦始皇二十六年（前221年），始置棠邑县，属九江郡。

楚汉相争，棠邑县初属楚。汉王三年（前204年）楚九江王英布以其地归汉。

汉，高帝六年（前201）封陈婴棠邑侯，为棠邑侯国，武帝元狩六年（前117年），改名，棠邑称堂邑。元鼎元年（前116年），堂邑侯国除，复为堂邑县，属临淮郡。东汉建武年，改属徐州广陵郡。

三国，广陵郡先属魏，至吴赤乌十三年（250年），归吴。堂邑县遂属孙吴广陵郡。

晋太康元年（280年），以堂邑属徐州临淮郡，元康七年（297年），置堂邑郡于堂邑县，隶扬州。东晋，成康四年（338年）江淮乱，百姓南渡，侨置堂邑郡于江南建康六合区境，有实土。

南齐建元元年（479年），析秦郡置齐郡，治瓜步（瓜埠），属青州。永明元年（483年），并秦郡入齐郡，将齐初恢复的堂邑县又并入尉氏县；永明二年以尉氏改属新昌郡。梁天监元年（502年），废齐郡复为秦郡，分尉氏县为堂邑、尉氏2县，太清三年（549年），侯景袭秦郡，改郡为西兖州。陈永定元年（557年）改复江北失地，恢复秦郡，堂邑、尉氏属之。太建五年（573年），北齐再取秦郡，置秦州瓦梁郡，随即为陈所收复，仍设秦郡；十年，改秦郡为义州，旋罢。北周于公元579年南下占领秦郡，改秦郡为方州，置六合郡，又置方山县，属方州。方州治于方山。

隋开皇元年（581年），废六合郡，以所领各县属方州。开皇四年，废尉氏、堂邑、方山3县，并置为六合县，属方州。