在基金的运作过程中，有一些必要的开支需基金承担，其中基金管理费和基金托管费是基金支付的主要费用。

管理费费率的高低与基金规模有关，一般而言。基金规模越大，基金管理费费率越低。但同时基金管理费费率与基金类别及不同国家或地区也有关系。一般而言，基金风险程度越高，其基金管理费费率越高，其中费率最高的基金为证券衍生工具基金，如认股权证基金的年费率为1.5%--2.5%。最低的要算货币市场基金，其年费率仅为0.5%--1%。香港基金公会公布的其他几种基金的管理年费率为：债券基金年费率为0.5%--1.5%，股票基金年费率为l%--2%。在美国等基金业发达的国家和地区，基金的管理年费率通常为1%左右。但在一些发展中国家或地区则较高，如我国台湾的基金管理年费率一般为1.5%，有的发展中国家的基金管理年费率甚至超过3%。

我国最初的基金管理年费率为2.5%。随着市场竞争的加剧，我国基金大部分按照1.5%的比例计提基金管理费，债券型基金的管理费率一般低于1%，货币基金的管理费率为0.33%。

为了激励基金管理公司更有效地运用基金资产，有的基金还规定可向基金管理人支付基金业绩报酬。基金业绩报酬，通常是根据所管理的基金资产的增长情况规定一定的提取比率。至于提取的次数，香港规定每年最多提取一次。