基地医院，配置在战区后勤基地的医院。通常由专科技术力量较强、设备较好、分科齐全的中心医院、驻军医院、专科医院、以及地方医院等担任。主要任务是收容集团军医院后送的伤病员、并实施专科治疗，一般留治两个月内能治愈归队的伤病员，对需要两个月以上才能治愈的伤病员组织向后方医院转送。基地医院可分为综合医院和
专科医院。
第二次世界大战期间，苏联军队设有基地医院。印度、新加坡等国军队在战时也设置基地医院。美军在战区后勤地带配置的驻军医院也相当于基地医院。
中国工农红军在四次反“围剿”时，设置了相当于基地医院的兵站医院。解放战争初期，设立了相当于基地医院的后方医院。
抗美援朝战争中，
中国人民志愿军在兵站区后部、靠近铁路干线终点地区配置了基地兵站医院。1979年
中越边境自卫还击作战时，
中国人民解放军在战役后方深远纵深配置了相当于基地医院的二线医院。中国人民解放军基地医院隶属战区基地兵站，通常由战区纵深向作战前沿地区梯次配置。基地医院通常由战区联勤所属军队医院或就地的地方医院担任，驻地相对稳定，装备条件较好，专科技术力量较强。按承担的战时救治任务，基地医院可作为综合医院、创伤外科专科医院、传染病医院、分类后送医院、中转医院使用。基地医院编成是在平时的中心医院或总医院编制基础上作适当调整，通常需要增加分类后送组。基地医院的基本任务有：收容来自野战医院和就近医疗机构后送的伤病员；对伤病员实施急救和专科治疗；留治两个月以内能够治愈和暂时不宜后送的伤病员；组织伤病员后送；实施伤病员残情鉴定和协助有关单位装配医用矫形器；必要时派出专科救治力量，对野战医院实施支援。