地层缺失（lacuna）简称“缺失”，指地史时期中地层记录的比较大的明显的中断，一般指由于假整合或不整合的产生而构成的地层缺失。如由于不整合而造成的地层缺失，从时间意义上来说，停止沉积的时间也就是对老地层侵蚀破坏的时间。不仅意味着停止沉积了一段地层，而且还包含着对已沉积的老地层侵蚀破坏了一部分。例如华北中奥陶统与中石炭统之间的平行不整合，缺失了上奥陶统、志留系、泥盆系和下石炭统。这一地层缺失表明不仅中止沉积了几个系的地层，而且还侵蚀掉了一部分奥陶系地层。

地质时期中地层沉积记录的比较大的缺失。通常表现为地层之间的不整合或假整合。缺失原因是该地区根本就未曾有过该地层的沉积，或是沉积后在上覆地层沉积前就遭受了剥蚀。其停止的沉积时期，也就是对老地层侵蚀破坏的时期。例如中国华北中奥陶统与中石炭统之间的平行不整合，缺失了上奥陶统、志留系、泥盆系和下石炭统的沉积。这些地层的缺失表明不仅中止沉积了几个纪的地层，而且还侵蚀掉了一部分奥陶系地层。

地层形成过程中因发生沉积间断或后期遭受隆升剥蚀而导致沉积记录不同尺度的不完备。简称缺失。以往的地层学研究主要依靠生物地层学方法判别是否存在地层缺失，因此在缺乏明显不整合面的情况下无法查明时限小于一个化石带（百万至几卜万年级）的地层缺失现象。当代高精度层序地层学（4至6级层序）、旋回地层学（米兰科维奇轨道旋回：偏心率、斜率和岁差）和磁性地层学（极性带、极性亚带）研究的开尾，可以表明十万至万年级精度的地层缺失现象。