圣痕计划，是手游《崩坏3》及其衍生作品中的设定，该计划是由前文明纪元的科学家梅和梅比乌斯共同指导的一项用于对抗崩坏的方案，计划的本质是让人类成为新物种，用以对抗崩坏，保留文明，重新定义人类与文明的存在，但归根结底，这项计划并不能彻底根除崩坏。

在前文明时代，梅比乌斯创造出了「圣痕」的原型，但在实验中发生了意外，梅因此介入其中，主导了圣痕的研究。梅比乌斯在梅的要求下拟定了15版的计划书，在第15版计划中，梅诠释了自己对人类和文明的定义，梅选择站在「文明」那边，梅认为人类只是文明借以诞生的基石罢了，比起个体的生命，由生命带来的「真理」反而是更加本质的存在。圣痕的最初设想是将人类的意志与虚数空间直接相连，但结果并不尽人意，所以才不得已制定了「圣痕计划」，一项以这种失败品为代价，去换取人类与文明未来的计划，梅声称这是所有计划中最差的一个。梅将毕生的研究转录到了人类的遗传因子中，当这些隐性遗传因子在一下个时代的人类身上表达时，她们的身体上会浮现出名为「圣痕」的印记。这些拥有遗传因子的少女们被保护在几百个安全舱中，等待着数万年以后的苏醒。

在前文明世代的末期，人类的科技水平已经发展到可以将知识转录成基因片段，用遗传物质作为载体将其流传下去。现代人类的体内均带有不同程度的圣痕基因片段，当基因片段在某个个体体内达到一定程度的完整度时，这些基因组会在人类体表构筑出印记——「圣痕」。

圣痕中记载着大量远超现代科学的技术、知识和力量，并会以现代科学无法解释的能力的形式在宿主身上直观地体现。圣痕各自拥有不同的特性，甚至拥有不同的能力。但无一例外的是，因为圣痕中的科技均是使用崩坏能驱动的，所以圣痕持有者都被赋予了极佳的个体崩坏能抗性。随着人类的世系遗传，基因不断变异和交换，原本完整的圣痕基因组最终离散。因此，尽管每个现代人体内都携带着圣痕基因，能天然表达圣痕的人却屈指可数。

在圣痕的这一特性被天命组织发现之后， 奥托便开始着手人工圣痕研究项目的进行。人工圣痕在一定程度上模拟了圣痕的运作，通过后期手术植入女武神体内后便能大幅度地提升她们的崩坏能抗性，但也因此她们必须承受极大的身体负担。然而，人工圣痕终究只是赝品。人类现有的科技完全无法解析圣痕内部的构成，只能依样画瓢地进行粗糙的仿制。因此只有增强崩坏能抗性这点被保留了下来，而其他的能力则被极大的弱化了。

「圣痕空间」是虚数空间中的一个特殊维度，它自有其结构和来源。「卡斯兰娜」血脉的源头是那些融入凯文体内的崩坏兽基因，诸多品种的崩坏兽力量在凯文体内交汇、融合，因此有了「奇美拉」的称呼，这也是「圣痕空间」得以存在的起点。

在距离终焉降临现文明的1500年，凯文在目睹了火种计划、方舟计划和恒沙计划的成果无望后，决定启动「圣痕计划」。凯文在一整座小岛上投放了「CYP-630」试剂，强制激活新世代的人类体内的圣痕基因，幸存者将成为新的物种，重新定义人类，而控制不了力量的人类则会变成死士。就结果而言，岛上只有千分之一的人觉醒了第一阶段，但这些人都会和圣痕产生排斥反应，凯文想让苏帮助自己为那些人觉醒第二阶段，但苏在见证了一整个村子的人都变成了死士的时候，下定决心阻止凯文。苏开启须弥介子，打算让自己和凯文永远留在量子之海，但最后凯文将苏推出了世界泡，自己选择留在了量子之海。

凯文从量子之海脱离后，回到世界蛇重新启动了「圣痕计划」，该次实验由世界蛇的干部「胡狼」进行主导，胡狼仍延续了之前人工干预激活圣痕的方法，采用了大剂量的崩坏能和试剂对整个天穹市的人口进行实验，让人类觉醒圣痕。但该计划最终被天命组织和琪亚娜联手破灭。

在胡狼进行实验的同时，世界蛇的另一个干部「羽兔」在悄然进行着另一版计划，羽兔依靠自己的「捕梦」能力制定的方案。「 旧人类」会以梦境的形式逐渐连接起来，并最终成为「新人类」的圣痕。该技术会让人消失在自己的梦境，让现实和虚幻彼此对调。精神转化为物质，物质转化为精神。在普通人全部消失之后，世界蛇会将它改造成适合新人类生存的世界。崩坏能将在所有人体内自由流转，律者再也不会出现。借助梦境人类可以彼此分享经验和感受。人类的梦境会聚集形成一个犹如星球般大小的梦境集合体——「精神的亚当」，计划的本质是一条锁链，它将无法自救的人们紧紧地缚在一起；我们可以简单地让他们随波逐流，也可以力所能及地对他们施以援助。这种援助对他们来说就是这场盛大的迷梦一在梦中， 他们成为亚当，他们化身天神。

这场计划的终点，具现化的圣痕会取代人类，而人类也会化入梦境，与过去的圣痕空间融为一体。人类的意识将转换为与圣痕相同的存在方式，从实数世界隐退到虚数的夹缝。而与此对应，圣痕中的思想会化作实体，逐步降临到外侧的空间。它们会相向而行，取代悄然安睡的人类。圣痕计划可以让「圣痕」取代「人类」的位置，他们会全盘继承人类已有的文明。

圣痕计划会在地球与月球之间构筑复杂的拟似时间晶体。圣痕空间在一定条件下可以与梦境相连，因为「梦」就是崩坏的思考方式，梦境的混乱造就了现实之外的空间，为圣痕计划营造了「捕梦」的可能，在这种情形下，即使一个人无法与圣痕的力量内外合一，他仍然可以将自己的实体与梦境交换，让圣痕代替他作为文明的基石存在下去。最终，整个地球都会被圣痕空间所置换，而文明，也将从这里开启自己全新的征程。这个过程会从世界的两端同时发起：在虚数一侧，它是最初的圣痕空间；而在现实一侧，它是终焉的归处、过往无数文明的终点——月球。

在前文明纪元的梅比乌斯的理解中认为，圣痕记录着人类的知识，也记录着人类的历史，对于文明而言，人类或许才是那些墙上的影子，而圣痕却是洞外那「真实」的一切。「圣痕计划」的宗旨就是抛弃被律者所诅咒的人类，以另一种基石重新定义文明。