国防大学设置有合同的战役指挥、军事思想和军事理论、国防研究、院校教育管理、军事与政治理论和研究生教育等10余个专业。其中“国防研究系”国防研究专业主要培训军队正军职以上领导干部和地方省级领导干部及中央国家机关有关部委正司局级以上负责干部，学制半年以内。“基本系”
合同战役指挥包括两个方向。指挥培训班：培养全军军以上单位指挥干部，学制1年；参谋培训班：培养全军军以上机关现职参谋人员，调学对象：军以上机关营职（含）以上参谋、干事，学制1年，毕业后，学员适合在军以上机关担任业务部门的领导职务。基本系师资培训班：培养全军中高级指挥院校的军事教员，调学对象为全军指挥与技术院校大学本科应届毕业生，学制为2年，毕业学员适于担任高级指挥院校的军事教员，科研单位的研究人员。进修系调学对象：正师职以上军事、政治、后勤指挥干部；全军院校校长；省军区系统正师职以上领导干部；
中级指挥院校军事教员和军事理论研究人员，学制半年以内。研究生院共设13个专业，主要培养具有硕士、博士水平的指挥人员、理论研究人员和教员。招生对象：大学本科毕业并经军队指挥院校培训，在军队任职2年以上的连职以上干部，学制2年半至3年，毕业学员适于从事指挥工作，军以上机关工作，理论研究和教学工作。