国家粮食局粮油资源综合开发工程技术研究中心下设综合办公室、工程化技术研究部、工程设计部、安全与质量检测中心和市场部。

油料资源开发新技术、新设备研究及工程化

谷物资源开发新技术、新设备研究及工程化

利用股无语油料资源开发特色产品

肉禽水产资料开发新技术、新设备研究及工程化

食品质量及安全

国家粮食局粮油资源综合开发工程技术研究中心于2004年9月24日在武汉工业学院开始组建，经过多年建设，现已建成稻谷、小麦、油料资源和饲料开发中试生产线各1条和粮油资源综合开发实验室、粮油资源检测室、谷物品质分析室、食品物性实验室、粮油工程设计室，总面积2400㎡，仪器设备总值达2000余万元。

综合办公室：处理中心日常事务，负责文书、档案、财务管，协调各部门间的关系和统一对外联系，组织开展学术交流，人才培训等。

工程设计研发部：组织和开展粮油资源综合开发、深加工的研究，工程化技术集成、组装和产业化开发。下设粮油资源综合开发工程技术室和粮油子与阿奴综合开发装备研发室。

工程设计部：从事粮油资源综合开发、粮油加工及装备的工艺设计、工厂设计，机械设计。安全与质量控制中心：从适量油资源开发，质量检测，和控制工作。