“国家环境保护农药环境评价与污染控制重点实验室”依托单位为环境保护部南京环境科学研究所，自 1978 年以来长期从事农药对生态环境影响与污染控制研究。实验室于 2002 年 6 月通过了原国家环境保护总局验收，是环境保护部首批认证和建设的重点实验室。

为国家农药环境管理提供技术支持，成为国家农药及农用化学品环境科技创新基地。

开展农药环境行为归趋、生态毒理及生态效应研究；持久性与环境激素类农药识别筛选技术研究；农药对水、土壤及农产品影响研究；农药环境风险评价与风险管理技术研究；农药面源污染控制技术研究。

实验室具有良好的科研条件，近年来购置仪器设备 3000 万元，具有气相色谱－质谱，液相色谱－质谱等大型仪器 50 余台；为加强农药环境野外试验基地的建设，2011 年建成了 36 亩农药环境影响与监控野外试验基地；实验室建立了一整套完善的质量管理体系。

重点实验室有一支精良的科研队伍，现有中国工程院院士 1 人，研究员 4人，副研究员 6 人，科研人员总数达到 31 人，其中博士 11 人，硕士 10 人。