国家海洋局南海分局是国家海洋局设在南海的海洋行政管理机构，其任务是按照国家有关法规、规定，代表国家海洋局履行在南海区的海洋行政管理职能，在海区组织开展海洋行政管理、执法监督和公益服务等项工作。

国家海洋局南海环境监测中心，地处广东省广州市，坐落于珠江岸边，北临中山大学，是隶属国家海洋局南海分局的独立事业法人单位。

南海环境监测中心成立于1980年，是中国南海区一个综合性海洋环境监测机构。无论是仪器装备、监测技术、人员结构，还是管理能力，在华南地区海洋环境监测系统中处于国内同行水平，得到社会认可。国家认证认可委员会计量认证评审组的成员给予评价和赞誉。1993年，中心通过国家计量认证；1998年，通过计量认证复查评审；2003年，通过计量认证复查评审；2011年3月，中心通过计量认证复查扩项评审。

（一）南海分局机关人员编制

机关行政编制94名，其中：局长1名，党委书记1名，副局长4名，党委副书记兼纪委书记1名。设11个处级机构，处级领导职数31名（含总工程师1名、工会主席1名、团委书记1名）。

（二）南海总队机关人员编制

中国海监南海总队机关参公编制40名，设总队长1名（局长兼任）、常务副总队长1名（副局长兼任），政委1名（党委副书记兼任）；设5个处级机构，处级领导职数13名（含副总队长2名、副政委1名）。

承担海区海洋工作的监督管理和海洋事务的综合协调，拟订区域相关海洋规划并监督实施，承担海洋听证、行政复议等相关工作。

承担国家海洋经济区海洋经济运行监测、评估及信息发布工作，组织开展海区海洋领域节能减排、应对气候变化等工作。

承担海区海域使用的监督管理，负责海区海底电缆管道铺设的审批管理。

承担海区海岛保护和无居民海岛使用的监督管理。

承担海区海洋环境保护的责任。监督管理海洋油气勘探开发、海洋倾废和局核准的海洋工程建设项目的环境保护工作；管理领海外等海域的海洋保护区，承担海区海洋环境突发事件的应急管理和海洋生态损害的国家索赔。

承担海区海洋基础与综合调查，监督管理海区海洋信息、海洋资料、海洋标准计量工作，推进海区科技兴海和公众海洋宣传教育工作。

承担海区海洋环境监视、监测和观测预报体系的管理，发布海区海洋环境通报、公报、预报和海洋灾害预警报；监督管理海区防灾减灾工作。

承担海区涉外海洋科学调查研究活动和涉外海洋设施建造、海底工程和其他开发活动的监督管理，承担有关海洋事务的国际合作与交流。

负责中国海监南海总队队伍建设和管理，承担海区海洋行政执法、维权执法工作，依法查处违法活动，负责船舶、飞机、陆岸设施管理和通信、机要保障工作。

承担国家海洋局交办的其他事项。

2021年7月，被中国自然资源部表彰为“自然资源部直属机关先进基层党组织”。