国务院西部地区开发领导小组下设办公室，在国家发展计划委员会单设机构，具体承担国务院西部地区开发领导小组的日常工作。

2000年1月，为落实以江泽民同志为核心的党中央作出的实施西部大开发、加快中西部地区发展的重大战略决策，加强西部开发的组织领导，国务院成立了西部地区开发领导小组。

2004年12月，国务院任命王金祥同志为国务院西部地区开发领导小组办公室副主任。

2005年8月，国务院任命曹玉书同志为国务院西部地区开发领导小组办公室副主任，王春正、李子彬、段应碧、王志宝同志不再任国务院西部地区开发领导小组办公室副主任职务。王金祥同志负责办公室日常工作。

2013年7月，根据国务院机构设置及人员变动情况和工作需要，国务院决定对国务院西部地区开发领导小组组成单位和人员进行了调整。国务院总理李克强担任组长，国务院副总理张高丽担任副组长。

2018年7月，根据机构设置、人员变动情况和工作需要，国务院决定对国务院西部地区开发领导小组组成单位和人员进行调整。国务院总理李克强担任组长，国务院副总理韩正担任副组长。

国务院西部地区开发领导小组下设办公室，在国家发展计划委员会单设机构，具体承担国务院西部地区开发领导小组的日常工作。

研究提出西部地区开发战略、发展规划、重大问题和有关政策、法规的建议，推进西部地区经济持续快速健康发展；研究提出西部地区农村经济发展、重点基础设施建设、生态环境保护和建设、结构调整、资源开发以及重大项目布局的建议，组织和协调退耕还林（草）规划的实施和落实；研究提出西部地区深化改革、扩大开放和引进国内外资金、技术、人才的政策建议，协调经济开发和科教文化事业的全面发展；承办领导小组交办的其他事项。