四川都指挥使司是官署名，简称四川都司，属于行省三司之一，明代四川地方最高军事领导机构。

元朝罗罗、蒙庆等处宣慰司，治建昌路，属云南行省。

洪武四年（1371年）六月平明升。七月置四川等处行中书省。九月置成都都卫。

洪武八年（1375年）十月改都卫为四川都指挥使司，治成都府。四川都指挥使司属于右军都督府。

洪武十五年（1382年）罢宣慰司。

洪武二十七年（1394年）九月置四川行都指挥使司。治建昌卫。领五卫、八所、四长官司。东北距布政司（成都府）千四百八十里，属于右军都督府。

成都左护卫、成都右护卫（后为龙虎左卫，隶南京左府）、成都中护卫（后为豹韬左卫，隶南京前府）、成都左卫（革）、成都右卫、成都前卫、成都后卫、成都中卫、宁川卫、茂州卫、建昌卫（后属行都司）、重庆卫、叙南卫、苏州卫（后为宁番卫，属行都司，革）、泸州卫、松潘军民指挥使司、岩州卫（革）、青川千户所、威州千户所、大渡河千户所

后来改制：

成都左护卫、成都右卫、成都中卫、成都前卫、成都后卫、宁川卫、茂州卫、重庆卫、叙南卫、泸州卫、利州卫旧无，后设、松潘卫旧为军民指挥使司，后改、青川千户所、保宁千户所、威州千户所、雅州千户所、大渡河千户所、广安千户所、灌县千户所，浦江关军民千户所（后革）

已下各所后设黔江千户所、叠溪千户所、建武千户所、小河千户所、蜀府仪卫司、寿府仪卫司（革）、寿府群牧所（革）