1995年，
四川农业大学李桂垣教授根据四川天全和
大邑县发表的旋木雀天全亚种Certhia familiaris tianquanensis可提升为种，称四川旋木雀C.tianquanensis。
2000年，孙悦华，Jochen Martens 在四川省洪雅县瓦屋山顶发现了李桂垣所描述的这种旋木雀，通过形态比较、鸣声分析和DNA鉴定，认定其为一个独立的物种——四川旋木雀（Certhia tianquanensis, Li）。
2004年，Paul Holt （英国）在陕西秦岭太白山录到了类似四川旋木雀的叫声，并给德国鸟类学家J. Martens寄送了相关录音。2005年5月6~15日，孙悦华，Jochen Martens 通过录音回放和捕捉辨认，发现四川旋木雀在秦岭确实有分布。在太白山发现四川旋木雀的林型以巴山冷(Abies fargesii)-糙皮桦(Betula utilis)为主，海拔为2600～2800 m，GPS为N34°01′,E107°48′。在洋县长青自然保护区发现四川旋木雀的林型以
巴山冷杉-红桦(B. albo-sinensis)为主，海拔为2550～2700 m， GPS为N33°42′,E107°36′。在以上发现四川旋木雀的地方，皆有
普通旋木雀同域分布。