四川农业大学土木工程学院是四川农业大学二级学院。

四川农业大学土木工程学院其历史最早可以追溯到二十世纪50年代的四川农学院和灌县林业学校。

二十世纪50年代，学校森林工程系开设的森林采伐与运输专业。

二十世纪80年代，又开设了土木工程专业。

二十世纪90年代，开设农业建筑与环境能源工程等专业。

2005年，经学校批准成立城乡建设学院。

1953年，教育部、农业部、林业部联合制定《中等农业技术学校调整的原则》，由大区制定具体调整方案，按照专一化、单一化，分期进行调整。成都农校森林科与其他6校的森林科391人集中调到灌县，建立灌县林业学校；后更名为四川省林业学校。

2001年4月，四川省林业学校整体并入四川农业大学设立都江堰分校。

2009年11月，更名为四川农业大学都江堰校区。

2012年12月，土木工程被列为四川省卓越工程师教育培养首批试点专业。

2014年3月，学校党委决定，撤销城乡建设学院，新组建土木工程学院，成为四川农业大二级学院。

截至2019年9月，土木工程学院设4个系；开办有3个本科专业。

截至2019年9月，土木工程学院拥有1个专业硕士学位授权点。

专业硕士学位授权点：建筑与土木工程

截至2019年9月，土木工程学院拥有1个为全国重点职教师资培养培训基地专业点，1个四川省卓越工程师教育培养首批试点专业；国家级在线课1门，省级示范课1门；出版教材近12部。

全国重点职教师资培养培训基地专业点：建筑工程施工

四川省卓越工程师教育培养首批试点专业：土木工程

国家级在线课：《结构力学》

四川省级示范课：《土木工程施工》

国家级教改项目：农林院校建筑与土木工程专业学位研究生校企联合培养模式研究与实践—以四川农业大学为例

四川省级教改项目：新工科背景下农业院校土木工程专业个性化人才培养模式探索与实践、基于卓越工程师培养理念的《土木工程施工》课程教学改革与探索

截至2019年9月，土木工程学院学生获国家创新训练计划项目12项、专业技能提升计划项目2项，省级苗子工程项目15项、创新训练计划项目22项、创业训练计划项目8项，专业技能提升计划项目3项；在大学生挑战杯竞赛中获国家二等奖2项、三等奖（铜奖）1项，四川省一等奖（金奖）3项、二等奖4项，三等奖7项；在中国“互联网+”大学生创新创业大赛中获省二等奖2项、三等奖1项；参加全国BIM竞赛获全能一等奖1项、二等奖5项，其中2015年获结构设计与结构分析专项一等奖；参加大学生结构设计竞赛获全国二等奖1项，省二等奖4项、三等奖6项。

2015年至2019年，土木工程学院有4人次获学校课堂教学质量奖特等奖，3人次获一等奖，4人次获二等奖；2017年获得学校教学成果奖一等奖1项、二等奖1项、三等奖1项，省教学成果奖三等奖1项。

2018年12月，《环境工程“综合实验”创新与实践》项目获四川农业大学教学成果二等奖。

2018年4月，《“卓越计划”背景下土木工程（教育）专业“双师型”人才培养体系构建与实践》项目获四川省教学成果三等奖。

截至2019年9月，土木工程学院有在职教职工42人。具有教授职称者4人，占10%；副教授职称者14人，占总数的35%；讲师、实验师、助理研究员等中级职称者22人，占55%。博士生导师2人，占5%；硕士生导师25人，占60.25%；具有博士学位者20人，占50%，硕士学位者9人（其中在读博士3名），占22.5%。具有国家注册结构、土木、监理、造价、安全、咨询等工程师，注册建筑师、建造师、实验检测师等注册执业资格的“双师型”教师21人，占52.5%。专任教师中，有2个校级课程团队，有四川省学术与技术带头人后备人选3人，2人入选住建部农房建设指导专家组专家，1人被聘为住建部防灾研究中心专家委员会委员，1人入选省减灾委员会专家委员会专家，1人入选省古迹遗址保护协会专家。另有外聘联合导师25人，具有硕士、博士学位者4人，占16%，具有高级工程师等副高以上职称者14人，占56%。

四川省学术和技术带头人后备人选：朱占元、罗鸿兵、邹祖银

住房和城乡建设部防灾研究中心专家委员会委员：朱占元

住建部农房建设技术指导全国专家组专家：朱占元（名单不全）

四川省减灾委员会专家委员会专家：朱占元

四川省文物古迹协会专家：朱占元

截至2019年9月，土木工程学院拥有1个省级科研平台，1个省级科研创新团队。

省级科研平台：“村镇建设防灾减灾”四川省高等学校工程研究中心

2015年至2019年，土木工程学院主持国家级项目13项，其中科技支撑计划项目1项，自然基金项目11项，全国新工科研究项目1项，国家级扶贫攻坚示范课题1项；省部级科研项目近30项；纵横向课题科研经费1500余万元；发表学术论文120余篇，其中SCI收录30余篇，EI收录40余篇，CSCD收录40余篇，其他中文核心期刊论文13篇；出版学术专著2部，授权专利30余项。

2018年至2019年，土木工程学院先后与中建一局集团、中国建筑西南勘察设计研究院有限公司、中铁二十三局集团建筑设计研究院有限公司、四川省川建勘察设计院、四川省第四建筑工程公司、成都光大建设集团有限公司等30余家单位签订了联合培养协议，建立了合作关系，搭建了实践教学平台。

根据2020年2月学院官网显示，土木工程学院常年开展“新生杯”、“卓越杯”、女生节等文化和体育活动，组织结构设计竞赛、BIM竞赛等科学竞赛。