善导寺并在西元一九八一年八月，在大雄宝殿旁，兴建九层楼高的慈因大楼，一九八六年十月完成，其中四楼是太虚图书馆，五至七楼是佛教艺术品展览场地，珍藏了中国北魏、六朝、隋、唐、宋、元、明、清至近代的艺术品，其中还有一尊「宋代木刻观音菩萨自在坐像」，年代约在西元一○○○至一一○○年，连基座高约一百公分，非常具有历史价值，曾在故宫博物院展示。
善导寺佛教历史艺术馆鉴于魏晋南北朝时之石窟造像，如：敦煌、云冈、龙门等石窟艺术，以及唐宋以后在民间广为发展的中国佛教艺术，现代不能普遍被民间欣赏，于是将寺内法师历年收集魏晋以来之各类佛像及书画，于手中辟一陈列馆予以陈列。
台湾地区各大博物馆中，虽然珍藏了许多我国历代文物，但有关佛教艺术的文物则不甚完整，尤其是魏晋至唐宋年间的石凋艺术精品甚为欠缺。善导寺为了弥补国内博物馆对魏晋至唐宋年间石凋艺术的不足，便广泛蒐集魏晋以来各类佛像及文物，于1986年成立佛教历史博物馆，开放给民众参观。该馆遂致力于蒐藏，以为弥补国内博物馆早于此一内容之缺憾。善导寺设有陈列室三间，分别设于五、六、七等三楼；五、六两楼为艺术馆馆址；七楼的艺文馆则展出佛教书昼。
五楼展出之各形石凋艺术，多为魏晋六朝时期佛教造像之艺术精品，历千百年而完整无缺，弥足珍贵。造像内容包括释迦如来、弥陀世尊、弥勒`菩萨、观音大士，另有男女
供养人立像。这些佛像凋刻时代历魏晋六朝、惰唐、北宋、辽、至情等朝。于造形上可以看出惰唐以前圆凋之法相，多以自然柔美为主，形态变化多，有正立相、有倒立相、有倚脚、也有盘坐相、有托腮思维、亦有深入禅定二百左右侧卧，亦有迹跌坐、半迹跌坐等：各各表情不同，个个传神互异，慈容满面，栩栩如生，洋溢着宁静与庄严的美感。
六楼收藏唐、宋、明、清以及近代的木凋佛像、陶瓷佛像、玉凋佛像、牙凋佛像以及金铜佛像。木凋佛像多巨大雄伟，有彩色、原色、金色三种木凋，可惜保存不易大多色彩斑驳，材木剥制。陶瓷佛像则以十八罗汉最为显目，其中由宋明时代各名窑烧制的佛像亦有多尊，如越州窑、景德窑、钧窑、口州窑、御窑等。玉凋、牙凋及金铜佛像型体小，较为精致。
七楼的艺文馆展出宋、明、清及近代的佛画，其中以宋代阿弥陀佛接引像、明代黄道周绘
普贤菩萨像和张大千所绘敦煌唐人壁画吉祥天女像最为重要，亦有文人书昼作更换式展出。