喀土穆于
1821年由
埃及领主穆罕默德· 阿里建城，作为埃及军队的据点。不过后来成长为包含
奴隶输出的区域交易中心。
1884年3月13日，效忠
马赫迪穆罕默德·艾哈迈德的军队包围了由
英国将领
查理·乔治·戈登带领的守军，之后对于本城的英埃联军大屠杀。
1885年1月26日，残破的喀土穆被攻下。后来在
1898年9月2日，由赫伯特·基奇勒带领的英军击败了守城的马赫迪派部队。
喀土穆有苏丹最大的空港:
喀土穆国际机场。也是苏丹航空主要的集散地。原本建在喀土穆市的南方，但随着城市的快速成长与附近地区的都市化，机场反而变成在市中心。