这份期刊与法国的《学者周刊》被世界各国专家公认为世界学术期刊的鼻祖。《哲学汇刊》后改名为《皇家学会哲学汇刊》，被认为是最老的同行评议科学刊物。现在已是正式学术刊物的基本准则，而这份历史悠久的刊物此后分为AB两卷一直延续到现在，至今仍在出版。
在17世纪，一些对自然科学的好奇者在各种非正式聚会中相聚，促成以学术交流为基本宗旨的
英国皇家学会等科学团体的建立。而现代意义上的学术期刊机制应该说就是英国皇家学会率先建立的。1665年3月6日该会在伦敦创办《Philosophical Transactions of the Royal Society》（《哲学汇刊》），目前是世界上创刊最早、寿命最长有较高学术价值的学术期刊。《哲学汇刊》创办者享利·奥尔登伯格（Henry Oldenburg）等人的初衷就是替代书信成为科学家之间交流的重要手段。
英国皇家学会是在1660年底成立的，在其成立后不久，首任会长莫雷就发现与各地学者的通信需要花费很多的时间和精力。他在1661年8月写给荷兰的惠更斯的信里就表达了要出版一种类似期刊的出版物的想法。但是，当时学会忙于起草特许状，制定管理条理，所以筹备出版刊物的计划同样没能及时实施。1663年4月，亨利.奥尔登伯格就任皇家学会的秘书，接管了莫雷的大部分信件往来的事务。实际上，奥尔登伯格自此开始了同世界各地的学者、科学家们广泛通信联系。他与其中至少30人保持固定的通信联系，他们之间的通信是连续的，并逐步形成一个比较正式的通信网。奥尔登伯格成了学会的“信箱”，他负责在学会的会议上宣读收到的信件，并加以整理归类和给予回复。不久，鉴于这项活动的费时费力，奥尔登伯格建议成立一个负责通信的委员会。学会同意了他的请求，成立了一个有20人的通信委员会。
《学者周刊》的创办给
英国皇家学会以直接的推动作用，促使他们将酝酿已久的设想付诸实践。1665年2月，莫雷写信给惠更斯，告诉他学会秘书奥尔登伯格将要创办一份学术期刊，这份刊物将避免像《学者周刊》那样因为内容而引起麻烦。“我们已经看到它的样本，并且也发现其中的内容确实有不妥的地方。你说的很对，这期刊很有用，如果它保证质量的话。奥尔登伯格给我们看了一份相似的计划草案，它准备创办一份以哲学内容为主的期刊，如果能实现，我们倒希望他尽快地创办这一期刊。在内容方面，他将不会涉及法律与神学事务，除了报道来自国外的哲学方面的资料外，他还将出版重要的科学实验报告”。很快，学会讨论了出版学会刊物的事宜。1665年3月1日，理事会决定：《哲学汇刊》由奥尔登伯格负责出版，如果他有足够的稿件，就在每月的第一个星期一出版，稿件由学会理事会根据特许状的许可范围审定，再由理事会指定会员复审。可见，《哲学汇刊》充分吸取了《学者周刊》的经验教训。
第一期《哲学汇刊》于1665年3月6日出版，共由16页纸，有“准予印刷”字样，在内容方面，有一篇奥尔登伯格撰写的导言。在导言中，奥尔登伯格清楚地表明这份学术期刊将致力于科学发现、知识经验的交流，改善和增进自然科学的研究。从第一期的目录中，可以看出奥尔登伯格为刊物征集的稿件范围非常广泛，涉及物理、天文、地理、航海和医学等各个方面的内容，突出的是实验和观察报告占据主体，另外还有3篇涉及对于科学仪器和技术发明的报道。这说明《哲学汇刊》是一份以观察和实验报告为主，内容广泛多样的纯科学期刊。
自创办后，奥尔登伯格一直全权负责《哲学汇刊》的出版工作，直到1677年7月他去世为止。在这期间，他共总出了136期，共12卷，并基本上是每月的第一个星期一出版，周期是罕见的准确稳定，这在当时是极为难能可贵的。在他的编辑出版下，《哲学汇刊》的影响日益增大，在国外的科学人员中也十分畅销，他们中经常有人寄来自己的研究成果希望学会给予刊登出版。《哲学汇刊》也因此成为当时最重要的科学出版物。奥尔登伯格去世后，《哲学汇刊》仍由学会的秘书负责出版，此后除了1676－1683年有过短暂的停刊之外，该刊一直持续出版到今天，成为历史悠久、影响广泛的一份科学期刊。