青岛产学研基地由哈尔滨工程大学国家大学科技园组织建设、运作和管理。科技园充分发挥了青岛产学研基地建设主体的作用，在选址、规划、落实政策等各方面积极筹划和运作，经过与山东省青岛市、原胶南市政府及有关部门的多次沟通和密切联系，最终促成了青岛产学研基地的奠基。
2004年3月，学校与山东省签署了《山东省人民政府哈尔滨工程大学全面合作协议书》，并进行一系列的洽谈与沟通，确定哈尔滨工程大学国家大学科技园为产学研基地的主要建设单位，实现双方在人才培训、技术咨询、技术研发、成果转化和技术信息交流等方面的合作。国家大学科技园依托自身已形成的较为完善的产业化体系和成果转化经验，将青岛产学研基地作为科技园孵化功能在山东省的辐射和延伸，打造哈尔滨工程大学“三海一核”及相关领域科技成果转化及产业化的重要平台。2005年2月，哈尔滨工程大学与
青岛市人民政府、哈尔滨工程大学国家大学科技园与胶南市人民政府分别签署了建设哈尔滨工程大学青岛产学研基地的协议，青岛市对哈尔滨工程大学青岛教学科研基地建设给予土地、资金、优惠政策等方面支持，哈尔滨工程大学依托青岛市，建设船舶技术研发基地和人才培养基地，为山东省船舶工业发展提供人才和技术
支撑。
在合作推进、建立青岛产学研基地的过程中，山东省有关领导、省国防工办、青岛市人民政府对学校给予了极大的关心和支持，双方进行了多次的洽谈、沟通和协调，为促成基地建设奠定基础。海军部队、中船重工集团对推进产学研基地的建设给予了很多的关注，并明确表示将以各种形式给予支持。
学校发展战略与山东省船舶工业发展规划的一致性，为双方的合作提供了良好的契机。这是符合学校“三海一核”发展特色，推进落实学校产业发展规划，顺应国家在21世纪积极发展船舶与海洋产业国策的重大举措。也是山东省积极引进具有船舶海洋领域技术优势的高校，吸引智力资源为船舶工业产业升级注入动力，打造强大的船舶海洋产业集群所采取的有力举措。
基地建设在青岛市黄岛区胶南，这里风光秀美、气候宜人，面朝连绵广阔的大海、背靠神奇俊美的大珠山，是一座宜居、充满灵性的海滨小城。这里的自然条件有利于该校进行科学研究，发展船舶与海洋科技产业，在为山东省船舶工业发展提供直接的技术和人才支持的同时，还将带动地方工业进一步向技术密集型和知识密集型深层次的发展，促进地方经济产业结构的升级，大力推进地方经济发展。
为更好地满足国防科技工业发展，特别是满足海军装备和船舶工业对高新技术的需求，科技园将加快科技成果产业化步伐，提高原始创新、自主创新能力，更好地服务于我国建设造船大国、强国的战略目标。同时，为山东省发展船舶工业支柱产业，以科技进步促进产业结构升级，迈向发展“蓝色经济”的宏伟目标开启新的篇章！