吴万福（？~1674），奉天辽阳（今属辽宁）人，汉军镶红旗人，明末清初将领。

初为明朝守备。清崇德七年（1642），清军围松山，吴万福随副将夏承德归降，隶镶红旗汉军。

顺治元年（1644），从征李自成。叙功，授骑都尉世职。三遇恩诏，加至二等轻车都尉。

顺治十五年（1658），加都督佥事，充新设之福建福宁总兵。

康熙元年（1662）六月，郑成功部伪总兵王士鳌、伪副将李礼泊船沙埕岛、青山岛。吴万福遣使招抚，王士鳌、李礼悔悟投诚，为伪水师都督阮述、陈文达围阻不得达。吴万福亲督兵夜驰，越岭杀贼千余，支援王士鳌、李礼突围而出。

康熙二年（1663）十一月，海贼阮春雷以船二十余窃据东蚶岛（东安岛）、长腰岛，窥福宁府。南明鲁王旧将张煌言率五十余船入闽，与阮春雷合。伪镇林国梁统三十余船来归，机密泄露，张煌言率众围之，林国梁斩张煌言之弟张嘉言，复以炮碎其船，乞援于吴万福。吴万福以福宁向无舟师，议用林国梁之船攻之，于是派遣游击李应先、刘成海等水陆夹剿，擒斩数百级，夺船械，毁东蚶、长腰贼巢，阮春雷、张煌言俱远遁。因功加都督同知。

康熙三年（1664）三月，阮春雷、张煌言复集百余艘泊三都岛、青山岛等岛，吴万福约水师总兵李长荣夹剿，李长荣趋东冲口，吴万福统林国梁船直抵官井洋，箭炮齐发，斩二百余级，焚其船五。贼窘退出东冲口，李长荣师适至，复进击贼北溃，遂合兵追至大洋，阵斩及溺死者甚众，获甲胄、旗枪无数。复穷搜三都、青山各澳，毁其巢，阮春雷赴泉州降。

总督李率泰疏请录叙，部议李长荣加二级，吴万福加一级。上谕总兵李长荣、吴万福进剿一处贼寇，攻战无甚悬殊，再加核议，寻议各加一级。得旨，李长荣加署都督佥事，吴万福加右都督。

康熙十三年（1674）四月，耿精忠叛乱，吴万福环城固守，城破死之，全家被害。幕客孙墢、百总潘腾凤并殉。康熙十九年（1680），诏褒恤殉难诸臣，赠吴万福左都督、太子少保，赐祭葬，谥“忠愍”。除所得轻车都尉袭替外，复荫子弟一人守备。

康熙三十五年（1696），福建巡抚卞永誉请建祠于福建，春秋致祭，得旨允。雍正二年（1724），入祀昭忠祠。

长曾孙：吴瑞麟，袭轻车都尉。雍正十一年（1733），与都统赵宏济会饮，革职，销除轻车都尉，仍留骑都尉世袭罔替。

次曾孙：吴祥麟，袭守备。

玄孙：吴锟监，吴瑞麟之子，袭骑都尉。

五世孙：吴国澍，吴锟监之子，袭骑都尉，曾任广西庆远副将。