吕子厚于
民国6年（1917）考入
南京金陵大学。该大学系教会所办，校长是美国人，歧视非教徒学生，强行奴化教育。吕子厚与进步学生掀起反奴化教育的学潮，赶走校长，集会立誓罢神学课。吕子厚于翌年转入南京国文东南大学就读，民国13年（1924）毕业。
建国前，吕子厚先后在亳县、阜阳、宿县、蚌埠、立煌、风台等师范学校任化学、生物教师兼校医。民国38年（1949）元月参加革命工作，先后任凤台联中教师、凤台卫生院医师、阜阳卫生学校教师、阜阳妇产医院医师、阜阳地区医院医师，一生大部分时间从事医师或医学教育工作。
吕子厚注重中西医结合治疗疾病的技术和理论，反对“医学全盘西化”的主张。他精读历代中医著作，收集民间验方，从西医理论和生物化学的角度加以研究，用之于临床治疗。他在治疗和教学中积累了“药用博物学”、“医学化学”等大量资料，并在此基础上整理撰写出《药性辨析》书稿。可惜因受政治运动冲击，书稿未能出版成书。1963年，吕子厚病逝于阜阳城。