吉行淳之介的处女作是1950年在《真实》杂志上发表的《卖蔷薇的人》。这个短篇小说描写了被卷入复杂三角关系中的几个青年的各自的心理活动,发表后受到文坛上的注意。1951年1月发表在《世代》杂志上的《
原色的街》,1952年发表在《三田文学》上的《山谷间》和发表在《群像》杂志上的《一次逃跑》都曾被选为
芥川文学奖的候选作品。获1954年芥川奖的作品《骤雨》通过对放荡青年同娼妓的关系的描写,反映了由于战争失去了青春的青年,陷入了虚无和混乱的性关系的陷阱。1956年吉行淳之介将原来的短篇小说《原色的街》经过加工,改成了长篇《原色的街》,主题是在原来的作品中经常出现的围绕性爱反映精神和肉体的分裂。紧接着他出版了回忆战争时期的长篇小说《火焰中》。《火焰中》表现出来的私小说式构思否定了战后派文学家的观念性,也表现出“第三代人”的共同特点。1957年发表的回忆祖母的《黑暗的房间》和1960年发表的描写同父亲关系不和的小说《电话和短刀》,也都表现出私小说的倾向。吉行淳之介的代表作品之一《娼妇的房间》,描写了主人公对自己与妓女的关系的反省,追究了人存在的本质和意义。《鸟兽虫鱼》,描述了一个在将要倒闭的出版社工作的主人公心情压抑,看街上的一切都呈石膏色,他遇到一个人不人鬼不鬼、面目全非的女性,一接触到那生命象在燃烧着的女性,主人公感到生命力恢复了。他们相互医治心灵上的伤痕,继续旅行着。1961年他在《群像》上发表的长篇小说《昏暗中的祝祭》以暗淡的笔触刻划了一个因同女演员恋爱,不得不抛弃家庭的男人的心理。1963年发表的《
沙上的植物群》是以通过性获得和丧失生命的充实感为主题的长篇作品。《星月是天上的空穴》(1966年)描写了中年作家同女学生之间的被虐性关系。这时吉行淳之介已离开“第三代人”确立了独立的作家地位,被视为艺术派的代表作家。《星月是天上的空穴》获得了文部大臣艺术选奖。其它获奖作品还有获得新潮文学奖的短篇集《突发事件》(1965年),获
谷崎润一郎奖的《暗室》(1969年),获野间文学奖的《到黄昏》(1978年)和获读卖文学奖的《皮包里》(1974年)。吉行淳之介其它较重要的作品有《漂浮的房间》(1955年)、《在沿海的土地上》(1959年)、《风景中的关系》(1960年)、《湿天空干天空》(1972年)等。
妻と恋人との间で振り回される男の姿を描いた作品。当时の宫城まり子との恋爱からディテールを构成したため、世间には「女优との交际の告白」と受け取られて、物议をかもした。吉行自身にはそうした意図はなく、あくまで私生活から切り离した作品として描いた。