古生物化学是古生物学的一个重要分支学科，是利用应用生物化学手段研究古生物的一门学科。

古生物化学是研究古老地层中所含生命有机质的一门学科。分子生物学家可以从地层化石中提取核酸、蛋白质、碳水化合物、脂质等进行分析研究, 从而推测这些化石中的生物在地球上存活的年代等。

从化石和沉积岩中测出的有机物的各种记录，可追溯到约32亿年前，其中最古老的记录是从南非得到的。已知的化学化石有卟啉、氨基酸、酚、有机酸、糖、胡萝卜素、碳化氢、脂肪酸、甲壳质、角质、肽、蛋白质、多糖等。美国Carnegie研究所的P．H．Abelson（1954）从泥盆纪的鱼化石等分析出几种氨基酸，以此为开端有了很大的进展。

1、生命的起源；

2、钙化的机理；

3、在分子水平上讨论进化。

古生物化学的研究对象是从岩层中发掘出来的化石。通过对化石的考察，配合对含化石岩层的了解以及其他一些有关地质问题的研究，就能解释古代生物中的各类问题。

古生物化学实验室装备有不同型号的生物显微镜、体视镜，并配有专用化石照相设备，供研究生专业学习和科研的使用。

由于不同的自然地理环境生活着不同的生物，也沉积着不同的沉积物，通过对其中化石的研究，可推断当时的古地理和古气候，对于探索生命的起源，阐明生物发展历史有着重大意义。而且有些矿产，如煤、石油等的形成与生物密切相关，通过研究可了解这些矿产的成因，对有机矿产的探查有重要意义。

古生物化学的另一成是对当前疾病流行史的贡献。通过遗体残留物中特殊成分的分子生物学分析, 证明某些疾病在远古时代就已流行。例如类风湿性关节炎一直被认为是一种现代病, 最早也不过起源于17 世纪。但通过古生物化学家的研究, 现已证明该病在中古时期就已经存在。古生物化学打开了研究过去生命的新的窗户。