反山遗址位于良渚遗址的偏西部的中心地区，其东南就是著名的莫角山超巨型中心基址，其余都是低洼的农田。

反山的海拔高度约10米，东西长90米，南北宽30米，总面积约3000平方米，高出地表约4米。早在20世纪60年代末“深挖洞”的高潮中，当地村民曾在反山南部挖了两个小型防空洞，其中偏西的一个出土了不少石器、玉器等，另一防空洞距反山最重要的大墓——反山12号墓南端仅50厘米。1985年，原长命乡(现属瓶窑镇)一企业的厂址选中了反山，厂区北围墙建在反山顶部北缘，浙江省文物考古研究所在得知这一信息后，于1986年5月8日正式进驻考古工地，次日便开始了考古发掘。

1986年5月至10月，经过考古工作者五个多月的发掘，不仅证实反山是一座由人工搬运土方堆筑形成的大土墩，土方量达2万立方米，而且还在已发掘的600平方米范围内，发现并清理了11座良渚文化显贵者大墓。从部分墓内残留的头骨和随葬品的分布位置，可以确定这些墓葬的朝向是头在南略偏西，个别为正南，都为长方形竖穴土坑墓。墓穴宽大，长约3米，宽约2米，多数墓深1．3米，墓内还有木质的葬具，有的甚至棺椁齐全。在发掘现场，往往能看到板灰的痕迹，有的板灰上还有大片的朱红色涂层。这些墓葬内出土了大量的珍贵文物，有陶、石、玉、象牙、嵌玉漆器等共1273件(组)，其中玉器占九成以上，单件统计数量超过3500件。通过这些墓葬内出土随葬品的类型学比对。