厦门市公路局是财政核拨的行政类事业单位，隶属市交通运输局管理，机构规格相当正处级。

现内设11个处室，下设直属、集美、同安、海沧、翔安五个分局，另有两个具有独立法人资格的财政核拨公益类事业单位，分别为厦门市公路养护绿化设施维护中心和厦门市公路桥隧维护中心（相当副处级）。全局现有事业在编人员252人，其中工人编制98人，本科以上学历215人（博士5人，硕士30人），各类专业技术人员110人（中、高级以上90人）。

2018年5月28日，入选中共福建省委文明办“福建省第十三届文明单位”拟表彰名单。