印加文明盖了许多庙宇献给他们的神明。其中最有名的包括了库斯科的太阳神庙、位于毕卡斯瓦曼（Vilcashuaman）的庙宇、以及的的喀喀岛的太阳神庙。印加人用精准切割的石块盖出了位在库斯科的太阳神庙。这个神庙周长超过1200呎，奉有巨大的太阳像。

印加人吸收邻近民族的信仰，同时也将帝国本身的信仰加之于在这些民族。其结果是，部落性的神明变成从属于印加人的太阳神因蒂信仰。印加人相信一位不可见的、难以察觉的、无法想像的造物神毕拉哥洽（Viracocha）或帕洽卡马克（Pachacámac）。这位造物神在传说之中比太阳神及其他神明的地位还要高。

印加文明是在以秘鲁为中心的安第斯山区古代文明的基础上发展起来的。与宗教结合的天文学有较高的科学价值。印加人认为高位神韦拉可卡是大地、人、其他神灵及一切活物的创造者，是创造文化的英雄，也是印加各部落的创造神。它创造了人，又加以毁灭，后又用石头造人。它被称为“世界之尊师，普天之最足智多谋，年高德劭之尊长”。

认为此神为一切权力之来源，无需为其划圣地，建神殿，仅有一人形金像。祈祷时，常先向韦拉可卡献上第一篇祷词，然后分别向日、雷、月、星及地母、海母祈祷。由于韦拉可卡的地位特别崇高，印加人平时求告的主要是其他一些较小的神灵，统称华卡。其中日神印蒂的地位最高，为各物神和印加王的祖先、保护者。其形象是一金制发光人脸，与雷电、气候神及月亮女神同住太阳神庙中，诸星神亦居于此庙。其中有的神被认为专管人间的一些特别事务，或照管一些有特别用途的动物。印加人还崇拜诸王的木乃伊，认为其具有超然的神力。祭祀常在室外举行。参加祭祀者应当洁净以符合礼仪，因此宗教活动往往伴以认罪、悔改、在活水中洗净身体等。神庙存放神像、圣器，祭司和“特选的妇女”亦居其中。祭典以供奉牺牲为主,通常的祭品是骆马、豚鼠和伊拉麻果(一种热带果品)。发生重大事件时（如印加王登基）,常将神庙中的特选妇女、战俘及儿童作牺牲祭神。有较为完善的教阶制度，祭司的等级分明并参预政治活动。大祭司为终身制，掌握实权,可婚娶,各地祭司皆由其任免。各地设有祭司学校。特选的妇女自幼在神庙培养，成年后或作帝王妻妾，或幽居神庙，需要时则作祭品献神。