卢仲佃（1521—1587），字汝田，后号怀莘，东阳卢宅人。明世宗嘉靖三十一年（1552）中举，三十五年（1556）进士。知晋江县，请筑安平石城，民以其城匾曰“卢侯城”。
任晋江令，节减民费，减免杂税。时倭寇为患，安海号称大镇，民数十万皆沿海而居，仲佃建议在安海筑城，拆废寺圯桥筑城，居民凭城拒守，得无恙。军饷缺乏，上级建议加征税收，卢仲佃再三申请免除税收，得百姓感激。
后改调福安，县城墙新为倭寇所破，仲佃率兵五千，加速进城，缮治城墙，招抚流民。忽报倭寇至三洋，三洋民十余万阻于水不得渡。仲佃以渔舟济之，百姓获全。倭掠三洋无所得，复自三洋攻城。城中人因前祸而害怕，争先逃避。仲佃令曰：“吾与汝一同死守，听任妇女出城，男子逃出者，砍左右脚。”民乃止，死守三昼夜，倭寇终不能得逞。
不久，擢南京刑曹。嘉靖四十四年（1565）十一月，转兵部
武库清吏司主事。时海瑞下狱，仲佃与同僚竭急以救，为徐阶所阻，引为终生之憾。隆庆元年（1567），升兵部侍郎，出守成都。值白莲教起义，百姓受死刑的有数百人。仲佃曲为宽宥。隆庆五年（1571），迁广东按察副使，转惠潮副使，后调湖湘。
楚王薨，世子方襁褓。武岗王谋署府事，与王戚共盗楚王积蓄。仲佃忤权相张居正之意，按王戚于法，剥夺其武岗府事职务。万历元年（1573），居正复告知仲佃，方便其二子乡试。仲佃复拒之。张居正不悦，调参江右，巡按南昌。宁州柯氏民相仇杀，宁州守张其事，请求剿灭。仲佃斥之。柯氏最后解散，守张其事得罪，仲佃升广东布政使。有因欺蒙朝廷而贬官的，怀疑仲佃，与前宁守一起构陷卢仲佃，卢仲佃于是左迁备兵惠潮。时流民占据山寨，兵燹不断，瘟疫流行。仲佃为劝降流民，积劳成疾，遇上瘴气，最终死于任上。