海南博鳌莲花馆是世界上第一座荷花主题博物馆，国内以莲花为主题的园有多家，但全面介绍莲花的科技、应用、历史等荷花文化知道专门展览馆尚属空缺。“博鳌东方文化苑·莲花馆”填补了这一国内空白。

博鳌莲花馆通过数字化手段全面展示莲花的历史、文化、科技、经济价值等综合知识，特别突出强调莲花与佛教、莲花与世界和平的主题；培育、栽种包括象征中日友好的千年古莲一大贺莲等各类名贵荷花，定期举办莲花节。

馆址占地面积600平方米，建筑面积1300平方米，展厅面积800平方米。主体建筑分上下两层，高11米。内设大小展厅6个，可举办各种类型陈列展厅。置有《莲花与中日友谊》、《莲花世界》、《莲花与佛教》三个文物专题陈列展馆、以及一个全数字化的《莲花科普》知识展馆、一个可供观众将展品带回家去的《荷花实用知识》展品。另有多功能展厅，可接待和举办各种莲花文化主题展览。

莲花馆特别聘请英国皇家摄影学会高级会士马元浩先生为馆长。馆内展出了马元浩近年来拍摄的以中国古代佛教人物雕塑和荷花为题材的摄影作品112帧，馆藏文物钟还有马先生多年搜集的荷花主题古代刺绣，陶瓷18件。是难得一见的民俗文物珍品。

莲花馆特别聘请中国著名植物学家王其超、张行言教授担任科学顾问，通过触摸屏数字系统以及模型 ﹑实物详尽展示了中国荷花种源及分布、裁培史略、形态结构、生态习性、繁殖栽培、品种改良、品种分类、园林应用、记载标准、品种介绍等内容。数字系统得到王其超、张行言教授特别授权，将《中国荷花品种图志》的荷花分类标准3系、50群、23类及28组搜集有荷花品种科学数据及图片712项全部整理搜集，是全世界最全面、最权威的荷花科学数据系统。