1973年:由于前一年的冲绳县复归的设置许可(第三种机场)。根据日本的航空法,本机场列为第三种机场。
1997年:新南大东机场启用,该机场跑道长1,500米。旧机场废止,设备转移到新机场。
上午航班为
那霸机场→南大东机场→
那霸机场的单向路线。下午航班为
那霸机场→南大东机场→
北大东机场→
那霸机场的三角单向路线。航班会在一周内依日子拆分为不同的顺行航线(2010年5月时刻表为星期二、三、四为“南大东 → 北大东”顺行航线,星期五、六、日、一为“北大东 → 南大东”顺行航线)。除了一部运费,即使是给北大东的经由航班成为与直达航班同样的运费的特例被适用。