南京大学哲学学院的前身是中央大学哲学系和
金陵大学的哲学系，创立于1920年。迄今已发展成为人才培养层次完备，师资力量雄厚，学科比较齐全，研究成就显著，在国内外有重要影响的哲学教学与研究基地。该系教师
胡福明在1978年撰写的《实践是检验真理的唯一标准》一文在当时的思想解放运动中产生了历史性重大影响，并直接成为改革开放的理论先声。
历史沿革
南京大学哲学学院的前身是
中央大学哲学系和金陵大学哲学系，创立于1920年。
1952年，院系调整时撤销系建制。
1960年，恢复设立政治系哲学专业。
1977年，恢复哲学系。
2000年在哲学系编制内设立宗教学系。该系另一源头为
金陵大学哲学系。
2024年7月9日，南京大学撤销南京大学哲学系（宗教学系），成立南京大学哲学学院。
学科建设
该系是中国首批获得博士学位授予权的哲学系之一。
2002年成为哲学一级学科博士学位授权单位，下设
马克思主义哲学、中国哲学、外国哲学、逻辑学、伦理学、宗教学、科学技术哲学、东方哲学与宗教学等八个
博士点和马克思主义哲学、中国哲学、外国哲学、逻辑学、伦理学、宗教学、科学技术哲学七个
硕士点，并设立涵盖上列所有学科的哲学
博士后流动站。其中马克思主义哲学专业为全国重点学科，宗教学专业为江苏省重点学科。
2008年哲学一级学科入选江苏省一级重点学科。该系教师还主持南京大学马克思主义理论一级学科博士点的建设工作。各学科层次亦均可接受访问学者、进修教师和海外留学生。
改革开放以来，本系在教学、研究和学科建设上取得了丰硕成果，其中既有在国内外处于领先地位或先进水平的基础理论成果，也有直接服务于经济社会文化发展的应用型成果。许多成果在国内外产生了广泛影响。现拥有一批学术造诣深厚，教学经验丰富，在海内外学术界有一定声望的老中青学者，已形成年龄与专业结构合理的学术梯队。
2000年以来，本系通过学科间优化组合、通力合作，承担了南京大学“创建世界高水平大学“
985工程”一期学科重点项目“哲学与当代中国的发展”、“儒释道与宗教学综合研究”和“现代西方哲学思潮研究”以及多项教学研究项目，研究条件有了较大改善，研究成果和学科建设取得了一系列重大进展。在985工程二期建设中，该系主持的“当代资本主义研究中心”和“宗教与文化研究中心”入选国家哲学社会科学创新基地，“马克思主义社会理论研究中心”入选教育部人文社会科学重点研究基地，带动了学科建设的整体发展。此外，该系还主持南京大学马克思主义研究院、中国文化研究院、中国哲学与宗教文化研究所、儒学与基督教比较研究中心、犹太文化研究所、旭日佛学研究中心、现代逻辑与逻辑应用研究所、科学技术与社会研究所、东方道德研究中心等科研机构的工作。
2024年7月，南京大学官网院系部门一栏显示，哲学系（宗教学系）、数学系、计算机科学与技术系已撤销，取而代之的是哲学学院、数学学院和计算机学院。调整优化二级学院设置是国内高校深化教学改革、激发办学活力，落实“院办校”理念的重要举措，是高校发展进入新阶段、面对新需求，实现学校事业高质量发展的必然要求。南京大学作为教育部直属的重点综合性大学，将在新一轮院系调整中焕发出新的蓬勃生机。
交流合作
该系致力于加强对外交流与合作，聘请了多位国际著名哲学家为兼职教授，与国外及港澳台多所大学和研究机构建立了稳定的合作与交流关系，举办了多次有重要影响的国际或两岸学术会议。每年均邀请数十位海外知名学者来系访问讲学，并有数十人到国外或港澳台地区访问讲学或参加学术会议，取得了良好成效。
教研条件
该系具有良好的教学、研究条件。系图书资料室藏书30万册（其中有《四部丛刊》、《
中华大藏经》、《道藏》、《
古今图书集成》等重要典籍），中外文期刊200余种，并和一些国家和地区的大学建立了紧密的资料交流。另设有现代化多媒体机房，可供师生直接在互联网上检索与阅读学术资料，并提供多媒体教学服务。
人才培养
本系是南京大学文科基础人才培育基地之一，十分注重学生的全面素质和创新能力的培养，着眼于培育基础扎实、知识面宽、适应性强的复合型人才，实行课堂教学、学术活动、社会实践相结合的“三元”教学模式，全面提高学生的综合素质。在本科生培养方面，近年来进行了以夯实理论基础、拓宽知识面、加强逻辑思维训练、培养阅读能力、提高论辩素养、强调经世致用、革新教学手段、加强教材建设为指导思想的教学改革。在研究生培养方面，各专业均以“建设一流学科、培养一流人才”为宗旨，注重培养研究生的理论思维素养、探索创新能力和综合素质培育。在严格管理的前提下，鼓励研究生参予各种学术活动，以本系研究生为主体的“博士论坛”在校内外有着广泛影响。除学校设立的奖学金外，本系还通过对外合作，设立了周恩来奖、金箔奖、华藏奖、道教奖、殷海光逻辑奖等一系列专项奖学金。多年来，该系培养了一大批哲学及相关学科教学科研高级专门人才和管理决策人才。各层次毕业生均以其较强的思想理论素养和实际工作能力、高度的社会责任感和健全的心理素质而享有良好的声誉。
该系首任系主任由著名的“
学衡派”领袖、时任副校长的
刘伯明教授兼任，此后，汤用彤、宗白华、方东美、唐君毅、牟宗三、熊伟、孙叔平、夏基松、林德宏、张一兵教授曾先后任系主任，现任系主任为宗教学与中国哲学专家徐小跃教授。
1977年10月恢复高考制度后，南大通过高考招生，录取了四年制本科生885名。其中，哲学系就有72名学生，包括上文提到的徐泽洲、黄浩涛、陈俊宏、周文彰等人。此外，还有江苏省政府副秘书长、办公厅主任李一宁，原江苏省建设厅厅长周游，原江苏省新闻出版局局长黄文虎，以及知名学者宋林飞、严强、童星等。
这群年轻人名义上是1978年初进入南京大学的，但实际上是1977级学生。这种特殊的“编制”，与当时最初恢复高考、招生时间的临时确定有关。
当时哲学系主任是著名哲学家孙叔平，而主持日常工作的则是系副主任、后于1978年写出著名理论文章《实践是检验真理的唯一标准》的胡福明老师。胡福明也是当时负责恢复高考后的首批学生的招生工作的老师，哲学系招了72个人，“是全校最多的”。
当时哲学系的学生，除了必修的哲学、社会学、法学等之外，还学过地质学、天文学、数理逻辑等等，甚至请过神学院的牧师来讲宗教学的课。而77级共有72名学生，他们因为联想到孔子门下有72贤人，曾以“72贤人”自勉。
机构设置
党务部门
党委书记：张建军
副 书 记：张传平
行政机构
系 主 任：唐正东
副系主任：王恒
副系主任：白欲晓
副系主任：张亮
主任助理：张传平
办公室主任：王玲
党委、人事秘书：吴雨芳
工会主席：肖玲
本科生教学管理办公室：季林
研究生教学管理办公室：周艳
学生工作办公室：范贇
资料室：曹立群、季 林
科研成就
南大哲学系部分著作一览
1. 孙伯鍨 金隆德，任吉悌，涂荫森 马克思主义哲学史（第一卷） 山西人民出版社 1982年8月
2. 孙伯鍨 金隆德，任吉悌，涂荫森 马克思主义哲学史（第二卷） 山西人民出版社 1986年11月
3. 孙伯鍨 主编 《简明哲学》 南京大学出版社 1985年
4. 孙伯鍨 《探索者道路的探索》安徽人民出版社 1985年7月
5. 孙伯鍨 张异宾主编 《西方最新哲学流派二十讲》 东南大学出版社 1987年
6. 孙伯鍨 童星 严强 《在反思和探索中前进》 南京大学出版社 1988年
7. 孙伯鍨 主编 《马克思主义哲学的历史和现状》（第一卷） 南京大学出版社 1988年
8. 孙伯鍨 主编 《马克思主义哲学的历史和现状》（第二卷） 南京大学出版社 1989年2月
9. 孙伯鍨 主编 《 马克思主义哲学的历史和现状》（第三卷） 南京大学出版社 1992年9月
10. 孙伯鍨庄福麟主编 马克思主义哲学史（8卷本）第2卷 北京出版社 1991年
11. 孙伯鍨曹幼华等著 《西方“马克思学”》 江苏人民出版社 1992年
12. 孙伯鍨主编 《现实与哲学 ──论中国特色社会主义理论的哲学基础》 南京大学出版社 1995年11月
刘林元主要著作：
1.《毛泽东哲学思想论》（南京大学出版社1993）；
2.《马克思主义哲学的历史与现状》（第三卷）（南京大学出版社1994）；
3.《跨越世纪的征途——第三代中央领导集体对邓小平理论的坚持与发展》（刘林元、姚润皋主编，南京大学出版社2000）；
4.《中国马克思主义理论的丰碑》（南京大学出版社2001）等等。
张异宾主要著作：
1.《马克思历史辩证法的主体向度》，河南人民出版社，1995年版；
2.《折断的理性翅膀》，南京出版社，1990年版；
3.《马克思主义哲学的历史与现实》（第三卷），南京大学出版社，1993年版；
4.《回到马克思――经济学语境中的哲学话语》 江苏人民出版社1999年版；
5.《张一兵自选集》 广西师范大学出版社1999年版；
6.《无调式的辩证幻想－阿多尔诺<；否定的辩证法>；的文本学解读》，南京大学出版社2000年版；
7.《邓小平理论与历史辩证法》 安徽人民出版社1999年版。
侯惠勤主要著作：
1.《马克思主义哲学的历史和现状》（第1卷）（主编，南京大学出版社1988年出版）；
2.《列宁主义的历史命运》（中国人民大学出版社1991年出版）；
3.《西方马克思学》（副主编，江苏人民出版社1992年出版）；
4.《正确世界观人生观的磨砺》（主编：南京大学出版社1996年出版，2001年作为教育部推荐研究生教材再版）。
赖永海主要著作：
1.《中国佛性论》 上海人民出版社1988年版 台湾佛光出版社1990年繁体字版， 中国青年出版社1999年版
2.《佛道诗禅》 中国青年出版社1990年版， 台湾佛光出版社1992年繁体字版
3.《宗教学概论》 南京大学出版社1990年修订版
4.《佛学与儒学》 浙江人民出版社1992年版台湾扬智文化出版公司1995年繁体版， 韩国云住出版社1999年版（韩文版）
5.《中国佛教文化论》 中国青年出版社1999年版
6.《湛 然》 台湾东大图书公司1993年版
7.《佛典辑要》 山东人民出版社1992年版 台湾圆明出版社1994年繁体字版
8.《济公和尚》 台湾东大图书公司1993年版
9.《楞伽经释译》 台湾佛光出版社1996年繁体字版
10.《维摩诘经释译》 台湾佛光出版社1997年繁体字版
11.《梁高僧传释译》 台湾佛光出版社1997年繁体字版
12.《唐高僧传释译》 台湾佛光出版社1997年繁体字版
13.《宋高僧传释译》 台湾佛光出版社1997年繁体字版
赖永海主编：
1.《中国文化精华·佛道卷》 中国青年出版社1999年版
2.《中国佛教百科全书》（11卷，280万字） 上海古籍出版社2001版
3.《禅学丛书》（三辑 16册） 浙江人民出版社与台湾扬智出版公司共同出版
4.《现代佛学文库》（第一辑 6册） 四川人民出版社出版
5.《禅学研究》（杂志） 江苏古籍出版社出版
李书有主要著作：
1.《儒家思想史》；
2.《儒学与社会文明》；
3.《中国儒家伦理思想发展史》；
洪修平主要著作：
1.《禅学思想的形成与发展》 佛光文化事业有限公司1991年
2.《禅宗思想的形成与发展》（修订本）江苏古籍出版社2000年
3.《中国禅学思想史》 文津出版社
4.《如来禅》 （合著）圆明出版社
5.《惠能评传》（合著）南京大学出版社
6.《十大名僧》
7.《中国佛教文化历程》
8.《禅学与玄学》
9.《肇论注译》
10.《佛教与中国传统思想文化》
徐小跃主要著作：
1.《中国宗教史》（上下卷）[合著]，齐鲁书社1991年版。
2.《中国无神论史》（上下卷）[合著]，中国社科出版社1992年版。
3.《哲学概论》[合著]，南京大学出版社1997年版。
4.《禅与老庄》[独著]，浙江人民出版社1992年版。
5.《禅林宝训释译》[独著]，台湾佛光山1997年版。
6.《罗教与<；五部六册>；揭秘》[独著]，江苏人民出版社1999年版。
7.《罗教与禅宗》[独著]，台湾佛光山法藏文库2001年版.
顾肃主要著作：
1.《科学理性论》，中国社会科学出版社；
2.《西方政治法律思想史》，南京大学出版社；。
3.《现代西方社会思潮史》（合著），山东教育出版社；
4.《正义与自由的求索——罗尔斯政治哲学述评》，辽海出版社；
5.《他山之石，可以攻玉――留学美国的思考》，湖北人民出版社；
主要译著：
6.《中国政治》，（合译），江苏人民出版社；
7.《自由的限度》，台湾桂冠出版公司；
倪梁康主要著作：
1.《胡塞尔：通向先验本质现象学之路——论现象学的方法》，硕士论文，《文化：中国与世界》（第二辑）；
2.《胡塞尔现象学中的存在信仰问题》，博士论文，德文版，德国克鲁威尔国际学术出版社；
3.《现象学及其效应—胡塞尔与当代德国哲学》，北京：三联书店；
4.《胡塞尔现象学概念通释》，北京：三联书店；
5.《胡塞尔现象学概念通释》，北京：三联书店；
主要译著：
6. 胡塞尔，《现象学的观念》，上海译文出版社；
7. 胡塞尔，《逻辑研究》，上海译文出版社；
8. 胡塞尔，《现象学的方法》，上海译文出版社；
9. 胡塞尔，《哲学作为严格的科学》，北京：商务印书馆；
主要编著：
10.《胡塞尔选集（上，下）》上海三联书店；
11.《面向实事本身——现象学经典文选》，北京：东方出版社。
郁慕镛主要著作：
1.《科学定律的发现》（专著 ），浙江科技出版社，1990年，
2.《辩证逻辑》（合著），吉林人民出版社，1981年
3.《科学逻辑》（合著），吉林人民出版社，1984年，
4.《自然科学认识论问题》（合著），湖南人民出版社，1984年
5.《大众逻辑》（合著），江苏人民出版社，1985年
6.《辩证逻辑导论》（合著）人民出版社，1989年
7.《形式逻辑纲要》（合著），江苏科技出版社，1992年。
8.《普通逻辑自学指导》（合著），江苏人民出版社，1997年。
张建军主要著作：
1.《科学的难题——悖论》，浙江人民出版社1990。
2.《矛盾与悖论研究》（合著）黄河出版社（香港）1992。
3.《形式逻辑指要》（合著），河北教育出版社1992。
4.《逻辑研究与应用》（主编之一），逻辑与语言学习杂志社1994。
5.《科学的难题——悖论（增订版）》，淑馨出版社（台）1994。
6.《辨证思维论》（合著），北京燕山出版社1996。
7.《矛盾与悖论新论》（合著），河北教育出版社1998。
8.《逻辑与知识创新》（合著），中国人民大学出版社2001。
郭广银主要著作：
1.《伦理学原理》（主编） 南京大学出版社 1995.2
2.《当代社会科学大词典》1995.7部分伦理学词条 南京大学出版社
3.《建设现代社会公民道德》 江苏人民出版社
4.《伦理学百科辞典》中国广播电视出版社 1999年1月出版
杨明主要著作：
1.《中华传统道德修养概论》（副主编），南京大学出版社1998
2.《当代中国道德建设》（合著，2），江苏人民出版社2000
3.《现代儒学重构研究》（独著），南京大学出版社2002
4.《权力观地位观利益观》（主编），中共中央党校出版社2003
5.《伦理新论》（合著，2），人民出版社2004
6.《应用伦理的热点探索》（主编，2），江苏人民出版社2004
7.《唐君毅新儒学论集》（主编，1），南京大学出版社2008
8.《现代西方伦理思潮》（合著，1），安徽人民出版社2009
9.《宗教与伦理》（独著），译林出版社2010
林德宏主要著作：
1.《科学思想史》；
2.《东方的智慧--东方自然观与科学技术的发展》；
3.《人与机器--高科技与人文精神的复兴》；
4.主编《高科技与社会文库》，曾获省社科优秀成果一等奖、教育部社科优秀成果二等奖、第十届中国图书奖；
5.《创造的动力》与人合作（三卷本）；
6.《科学技术概论》
郑毓信主要著作：
1.《数学教育哲学》 四川教育出版社2001年；
2.《数学教育的现代发展》江苏教育出版社1999年；
3.《数学方法论入门》；
4.《数学哲学新论》 江苏教育出版社1990年；
5.《数学方法论》 广西教育出版社1996
6.《现代逻辑的发展》 辽宁教育出版社1989年；
7.《关系映射与反演方法》 江苏教育出版社1989年；
8.《数学模式论》 广西教育出版社1993年
9.《数学思维与数学方法论》（合著） 四川教育出版社2001年
10.《数学文化学》（合著） 四川教育出版社2001年 11.《数学哲学中的革命》 （合著） 九章出版社1999年
12.《认知科学 建构主义与数学教育——数学学习心理学的现代研究》（合著） 上海教育出版社1998年
13.《数学-逻辑与哲学》 （合著）湖北人民出版社1987年
14.《数学抽象方法与抽象度分析》（合著） 江苏教育出版社1990年；
15.《西方数学哲学》（合著） 人民出版社1986年
16.《数学方法论教程》（合著） 江苏教育出版社1992年
17.《问题解决与数学教育》编著 江苏教育出版社1994年
肖玲主要著作：
1.《科学认识思想史》（林德宏、肖玲等著，江苏教育出版社会1995年出版）
2.《科学革命与战后资本主义社会的新变化》（合著，新华出版社1998年出版）
沈骊天主要著作：
1.《当代自然辩证法》 南京大学出版社1997年
王月清主要著作：
1.《中国佛教伦理研究》，南京大学出版社；
2.《净土三经释译》，佛光出版社；
3.《金刚经评析》，江苏古籍出版社；
4.《中华传统道德修养概论》（副主编），南大出版社；
5.《中国德育思想史》（参著），江苏教育出版社；
6.《伦理学原理》（参著），南京大学出版社；
7.《中国典籍精华·佛道卷》（合著）；
8.《中国佛教伦理思想》[台]，云光出版社；
9.《中国佛教文化艺术》（主编），宗教文化出版社；
孙亦平主要著作：
1.《吴文化论丛》 参著 江苏人民出版社1995年版
2.《如来禅》 合著 第二作者 浙江人民出版社1997年版
3.《惠能评传》 合著 第二作者 南京大学出版社1998年版
4.《西方宗教学名著提要》主编 江西人民出版社2002年版
唐正东主要著作：
1.《正确世界观人生观的磨砺－－马克思主义著作精要研究》，南京大学出版社1996年11月版，参著，第2、3章，约4万5千字。
2.《邓小平理论与历史辩证法》，安徽人民出版社1999年版，参著第7章。
3.《走进马克思》，江苏人民出版社2001年版，参著。
4.《斯密到马克思：经济哲学方法的历史性诠释》，唐正东著，南京大学出版社2002年版，36万字。
5.《思想的力量》，张异宾、唐正东编，南京大学出版社2002年版。
6.《探索与反思》，张异宾、唐正东编，南京大学出版社2004年版。
7. 《经济哲学视域中的当代资本主义批判理论》，唐正东、孙乐强著，江苏人民出版社2009年版，30万字。
8. 《马克思哲学的历史原像》，人民出版社2009年版，参著。
9. 《从斯密到马克思》（第2版），唐正东著，江苏人民出版社2009年版。
10. 《马克思恩格斯哲学原著选读》，唐正东编著，北京师范大学出版社2010年版。
译著：
1．《自然的理由----生态学马克思主义研究》，[美]詹姆斯·奥康纳著，唐正东、臧佩洪译，南京大学出版社2003年1月版。
2．《黑格尔的幽灵》，[法]阿尔都塞著，唐正东、吴静译，南京大学出版社2005年2月版。
蔡仲主要著作：
1.《数学文化学》， （与郑毓信合著） 四川教育出版社，2001年1月。
2.《理性、真理与权力——析后现代科学思潮中的反科学主义》（博士论文）
3.《索卡尔事件”与科学大战——后现代视野中的科学与人文的冲突》，南京大学出版社，2001年。
杨维中主要著作：
1.《道生大师传》台湾、佛光出版社1997.7.
2.《中华传统文化道德修养概论》 南京大学出版社1998.9. 参编
3.《中国佛教全书·仪轨卷》 台湾·佛光出版社1999.9 第一作者
张亮主要著作：
1.《邓小平理论与历史辩证法》（合著），安徽人民出版社1999年版
2.《走近马克思》（合著），江苏人民出版社2001年版
杰出校友