千佛殿的历史距今约一百五十多年前，它是贤劫千佛总集之化现。是由莲华生大士心之化身、无比虹身、开取伏藏之大成道者——尊者白玛邓灯大师，应雪域众生业力成熟之缘故，在
康区新龙县朗朗神山之南，空行佛母预言授记之处，天然而成莲华生大士光明金刚（普巴金刚橛）之地，建立了法轮福德等同稳固天成的桑耶寺的贤劫千佛法院——嘎绒寺。嘎绒寺的寺内还保存有西藏地方政府派人从昌都铸造的金刚莲花生佛像。
千佛殿是寺内规模较大保存最完好的一座建筑，始建于唐贞观年间，殿内梁间有“大明万历十五年岁次丁亥九月八日德府重修”的题记。殿宇彩绘斗拱，疏朗宏大，出檐深远，柱础古朴。特别是殿门两侧的八根复莲龙凤柱础，雕工隽永精美，花纹细秀流畅；或抚它一下，或站它旁边，自己也觉变得魁梧俊美了许多。此殿因殿内佛像众多而得名。殿内正中台座塑大佛三躯，称“三世佛”。中为法身佛，坐莲花宝座之上，为藤胎漆髹塑造；东侧为铜塑报身佛，亦称大慈大悲佛；西侧为应身佛，亦即释迦牟尼佛。大殿内前后左右原有铜、木小佛像足千尊，屡遭劫难，仅存小木刻佛像293尊。然而这也不足为奇，最为天下人称道的莫过于殿内那活灵活现的40尊
彩塑罗汉。据说这些塑像皆以现实人物为模特儿，且多是取自那个年代的高僧师祖。所以，这些与真人相差无几的彩塑不仅无一雷同，就连他们的神态气质乃至衣着，也完全符合各自的身份、地位和性格特点。
于金猴年三月初十日，祖师白玛邓灯开始为嘎绒寺贤劫千佛殿奠基，此时天空突然布满了五色的彩虹与光环，花雨自半空纷纷飘落，处处弥漫着扑鼻的香气，大地响彻着美妙的乐声，最后彩虹和光环全都融入了寺庙的地基中。祖师又亲见十方诸佛菩萨，尤其是贤劫千佛全部都融入大殿之中，寺庙也由此而得名嘎绒（贤劫）千佛寺。经过众弟子及善信们的努力，三年后完成了三身佛土庄严大殿等建造任务。
因为尊者对一切佛法仁波切同样有着无比的恭敬故，以及领悟一切教法之究竟的密意故，所以大殿内绘有四大教派传承的壁画，壁画所用的颜料全为祖师掘藏所出之伏藏品：宁玛巴所有教藏传承上师，诸坛城本尊；噶举派大手印所有传承上师，诸坛城本尊；新译教法开显者萨钦根嘎宁波等菩提道果法传承，坛城本尊喜金刚等；深广大车宗喀巴大师等菩提道次第传承，坛城本尊金刚大威德等。
大殿的墙体内作为伏藏安放了自达柯的帕乌白玛（地名）内掘藏而出的一千尊佛像。自朗朗神山掘藏出一千尊佛像，亦迎请入大殿墙体与地下。祖师还扛着布袋，站在大殿天窗顶上，松开袋口后，只见里面有数不清的本尊、佛像、法器等如雨一般纷纷落下，径直融入大殿地基中而不见了。大殿的四根柱子内分别安放了天生铁
金刚杵，祖师还特别吩咐，今后这四根柱子无论如何是不能动的。大殿的二楼悬挂满了宝瓶以及各种法器，这些也都是祖师伏藏中所取来，但一般是看不到的。后来有一位掘藏师甲绒敦根来到大殿后说：白玛邓灯祖师真是与众不同，到处都挂满了法器。他问周围的
喇嘛能看见吗。大家都说看不见。于是他就从腰间取下
金刚杵不断在空中四处敲击，周围的人便都听到了各种法器的响声。最后，祖师为大殿开光时，各人所见又均不相同，有的只见到彩虹及光环，有的还见到每个彩虹光环中都有一尊佛像，更有人还见到彩虹的光辉中，无数金身佛像如下雨般纷纷融入大殿当中。
祖师说：“本寺与稳固天成桑耶寺的神力相等，凡见闻觉知者均将获得菩提解脱之种子。”祖师还亲自预言，在不到二百年的将来，将有汉人弟子来嘎绒寺帮助建设寺庙及学法，嘎绒寺所传承之教法将传到大海之边。但在当时，很多百姓都当作奇谈，视之为不能相信之事