十二大愿是《药师琉璃光如来本愿功德经》中的内容。是指药师琉璃光佛发十二誓愿，要救众生之病源，治无明之瘤疾。

库木吐喇石窟16窟，主室为纵券形顶中心柱窟。该窟主室左右侧壁绘大幅经变画，其画面、构图形式完全相同，中间为横长方形的中堂式画面，两侧配以立轴式的条幅，条幅自上而下画出多组人物形象，可惜画面已被熏黑。据部分情节和汉文榜题，可知其内容是“十二大愿”。汉文榜题为：

第二愿者使我来世自身光明口口

琉璃内外明彻净无瑕秽妙口囗大

功德巍魏安住十方如日临世口口

众生悉蒙开晓

第三愿者…….世……

…….圆……益

无饥……想……

其余榜题文字多不可辨。第一愿的榜题，据日本人渡边哲信的录文是：第一愿者使我来世……自身……

三十二相八十种好……令一切众生知我这里所说的“十二大愿”，是指药师琉璃光佛发十二誓愿，要救众生之病源，治无明之瘤疾。“令诸有情所求皆得”（《药师琉璃光如来本愿功德经》），满足众生之一切欲望。