《医门棒喝》是清代医家章楠的一部力作。其内容以阐释《伤寒论》及发挥温病学说为主。《医门棒喝》初集为杂论性质的医书，其体例仿照徐大椿《医学源流论》，共有论文二十七篇，附十三篇，冠以条例十则。
收集章氏“天气阴阳论”、“太极五行发挥”等30余篇论文。杂论医学理论、诊法及内、儿等科疾病的证治，并附医案。文中不仅从正面阐述原理，而且评论诸家流弊，犹当头一棒以警当世。且能结合临床经验加以说明。学术上推崇
叶天士。对刘河间、李东垣、朱丹溪、
张景岳诸家亦能择善而从。在温病的辨证施治方面有不少新的见解和发挥。文中首概“辨证论治”，其意义与现时提倡的“辨证论治”极为不同。此书另有一种刊本，将医论部分为初集，将其
《伤寒论本旨》九卷为二集。现存多种清刻本。
章氏确是一位具有多方面学识素养和高深造诣的临床家、理论家。他著书的宗旨是“洞见本源，救正阙失”，字里行间流露出叩颡泣血，为民请命的仁者胸怀，其思路绵密细致，行文恣肆透彻，剀切陈明，反复详辨，必期理明义尽而后止。这种忠于医学，执着求索的精神值得学习。
中国中医研究院图书馆所藏清同治六年丁卯(1867)聚文堂刻本为底本，以宣统元年已酉(1909)蠡城三友益斋石印本为对校本，并参校了民国八年(1919)裘吉生补刻本。石印本原有“海宁王孟英先生评点”字样，经核对，与聚文堂刻本田晋元评点基本无异，恐为坊间伪托。其眉批多为褒语，间有论及医理者，限于体例，一并删去。裘氏藏本记载了吴鞠通对此书的评论，两位医家互相请益问难，评论得失，在医学史上开创了良好的先例，特以注语形式保留这一部分珍贵资料。