北京大学肿瘤医院云南医院为第二批
国家区域医疗中心试点项目。医院位于中国（云南）自由贸易试验区昆明片区，规划土地150亩，规划设置床位1000张（一期设置床位600张，二期设置床位400张），依托云南省肿瘤医院自贸区分院建设，由北大肿瘤医院主管主营。
预防保健科/内科：呼吸内科专业；消化内科专业；血液内科专业/外科：普通外科专业；骨科专业；泌尿外科专业；胸外科专业/妇产科：妇科专业/耳鼻咽喉科：耳科专业；鼻科专业；咽喉科专业/口腔科（门诊）/肿瘤科/精神科：临床心理专业/急诊医学科/康复医学科/麻醉科/疼痛科（门诊）/重症医学科/医学检验科：临床体液、血液专业；临床微生物学专业；临床化学检验专业；临床免疫、血清学专业：临床细胞分子遗传学专业/病理科/医学影像科：X线诊断专业；CT诊断专业；磁共振成像诊断专业；核医学专业；超声诊断专业；心电诊断专业；介入放射学专业；放射治疗专业/中医科：肿瘤科专业；针灸科专业；推拿科专业/中西医结合科。