北京外国语大学日语系具有学士、硕士、博士学位授予权，是国内办学层次齐全、质量较高的日语系。日语系教学层次分为本科、硕士、博士研究生，实行本、硕、博连贯制的教学科研体制。日语系创建于1956年，其前身为
外交学院设立的日语专业。1962年并入北外亚非语系，1981年独立建系，1986年成为硕士点，1993年被教育部定为全国第二个
博士学位授予点，确立了国内日语专业教学的最高层次。
北京外国语大学日语系每年招收3个本科班，总人数为70~72名。一个硕士生班20人，博士生3名。本科生教学分为零起点和高起点两个层次，零起点班招收经全国统一考试选拔的学生（两个班），高起点班主要从全国各省市重点外国语学校招收日语考生（一个班），并根据学生的不同特点分别进行零起点和高起点的教学，以培养具有扎实语言基本功和一定专业技能的
复合型外语人才为目标。
在语言基本功方面，培养学生“听、说、读、写、译”全面发展的一流日语能力；在专业技能方面，在高年级开设日本语言学、日本文学、
日本文化、日本经济等领域的研讨课，为培养学生的专业水准的学术素养打下基础；在培养复合型人才方面，鼓励学生兼修
北京外国语大学国际商学院、
北京外国语大学国际关系学院、
北京外国语大学法学院开设的
第二学位，或辅修专用英语学院开设的具有专业英语水准的课程，使学生在掌握专业知识之余扩大知识储备，为成为复合型外语人才打下坚实的基础。
专业课程主要有：日语精读、日语会话、日语视听说、日语泛读、日本文学选读、日语笔译、日语口译、日语
同声传译、日语写作、古典文学、日本文化史、日本文学研究、
日本近代史、日本古代史、日本经济学概论、日本企业管理、国际关系、
日本政治、
中日关系、
茶道实践等课程。
日语系拥有一支外语水平高、专业知识精湛、热爱教育事业的教师队伍。现有教授6名、副教授11名、讲师5名。教师中获得硕士学位的有7名、获得博士学位的有10名，还有3位教师正在攻读博士学位。另外，日语系每年聘请两名日本专家，同时与日本交流学校互派教师。此外，还聘请了多位国内外知名人士担任我系的名誉教授、客座教授。他们在日本语言学、日本文学、日本文化、日本社会等方面各具专长，学术和教学水平高，是一支实力雄厚、整齐精干的教师队伍，科研方面，教师编写、编著了多部教材和工具书，同时不定期出版高质量的论文集。
毕业生就业去向主要为：外交部、商务部、财政部、
教育部等中央各大部委外事机构，以及国家新闻机构、各省市外办、大学、科研院所和金融、旅游机构以及很多大中型国有企业和丰田、索尼等日本跨国企业等。。日语系和日本的
早稻田大学、
立教大学、
大东文化大学、
名古屋外国语大学、
青山学院大学、
樱美林大学、
爱知文教大学、
朝日大学、
长崎纯心大学、神户松荫女子学院等院校建立了校际交流关系，每年都有20多名研究生、本科生被选派赴日留学。