“刺客导师的职责是在组织借自由意志追求和谐的过程中，监督和协调组织的行动。”

十字军东征时期是已知最早出现“导师”这个称谓的时期，黎凡特刺客的领袖拉希德丁·锡南被称为“阿尔莫林”，即阿拉伯语“导师”的意思。然而后来阿尔莫林使用它的伊甸苹果来对马斯亚夫的刺客进行洗脑，并声称自己拥有控制他们的权利。最终他被他的学生阿泰尔·伊本-拉阿哈德杀死。

阿泰尔继承了锡南的导师位置，并对刺客组织进行了改革创新，这些改变以及他本人的努力深深的影响了刺客，使得阿泰尔成为了整个组织最具传奇性也是最受人敬仰的导师。

1227年，在阿泰尔前往蒙古的期间，阿泰尔的同年对手阿巴斯·索菲安发动了政变，黎凡特刺客兄弟会落入了阿巴斯的控制。阿巴斯篡夺了导师的称谓，并无视信条的约束，残暴地统治了马斯亚夫。直到1247年，阿泰尔杀死了阿巴斯，夺回了导师的称谓。阿泰尔又持有导师这个称号长达十年之久，直到蒙古人进攻马斯亚夫期间，他解散了黎凡特刺客，并于1257年8月12日在他的图书馆中去世。

“从现在起，你将会被称为导师，我们组织与秘密的守护者。”

―尼可罗·马基亚维利对艾吉奥

1503年8月，由于多年对抗波吉亚家族的功绩，艾吉奥·奥迪托雷·达·佛罗伦萨被尼可罗·马基亚维利提升称为意大利刺客兄弟会的导师。他持有这个称谓多年，并在游旅君士坦丁堡期间领导了奥斯曼刺客。

1512年，从奥斯曼帝国回到意大利后，艾吉奥辞去了导师的工作，并指认卢多维科·阿里奥斯托成为他的继任。

截至1511年，一位阿泰尔的后代——伊斯坎德尔——担任埃及刺客的导师。在遭到逮捕监禁后，它曾收到过艾吉奥的援助。

在艾吉奥放下刺客工作一段时间后，中国刺客邵君和她的导师朱九渊试图逃离中国，逃离嘉靖皇帝的清洗。然而，当两人来到佛罗伦萨后，朱九渊因保护邵君而被嘉靖派来的士兵杀死。邵君找到艾吉奥请求他的帮助。

18世纪晚期，殖民时期的美国的大多数刺客都惨遭清洗，其中的幸存者阿基里斯·达文波特为美国刺客兄弟会的导师。在美国独立战争之前由于与圣殿骑士有关于他性命的协议，阿基里斯对训练新的刺客犹豫不决，但最终，他接受并训练北美原住民莫霍克人拉顿哈给顿（康纳）成为组织的新成员，并终身栽培他。

在阿基里斯的管理下，兄弟会焕发新生，由康纳领导的战斗也极大地削弱了圣殿骑士在殖民地的影响。他在达文波特庄园领导刺客，圣殿骑士也轻视了他所集结的海军力量。在他死后，康纳杀死了其余一些圣殿骑士，并可能成为了实际上的导师。

19世纪末，一位俄罗斯刺客导师自己亲身参与以及伴随俄罗斯刺客的努力推翻了沙俄皇室的皇权统治，1888年，他指派尼古拉·奥列洛夫去刺杀从克里米亚回圣彼得堡的沙皇亚历山大三世。1908年，他又指派尼古拉去圣殿骑士位于通古斯的研究设施取回伊甸碎片之一的沙皇之杖。

1998年起，一位神秘人作为导师领导了整个组织，出于安全考虑，他的名字与地址常常作为秘密保护，甚至连刺客们本身都不知道。为了避免被找到，他在全世界游走。2000年11月，这位导师邀请了丹尼尔·克洛斯到他在迪拜的秘密总部，他们已经监视丹尼尔长达两年，并认为丹尼尔是个合格的学徒。

然而丹尼尔的大脑曾被Abstergo研究过，并且被植入了杀死导师的神经冲动，在收到导师赠予的袖剑后，丹尼尔用袖剑杀死了导师。刺客组织因此陷入了混乱，并转入地下工作，之后实际上是由威廉·迈尔斯在领导。