皇太子萧定权（
罗晋饰）不得父皇宠爱，在经历了冠礼案、春闱泄题案、军马案、童谣案等一系列事件后，萧定权逐渐成熟成长，更坚定了重道轻术的决心。齐王被贬离京后，萧定权本想与陆文昔（
李一桐饰）过平静的生活，却发现陆文昔受到未知势力要挟。萧定权不希望再看到争斗，想要借赵王婚事消弭争端。许昌平、陆文昔助萧定权在关键时刻逆转局势，三人联手，终于让幕后之人露出马脚。顾思林死讯突传，萧定权亲往长州平息局势。皇帝终觉后悔，对萧定权道歉。
《别云间》的内容被认为是《鹤唳华亭》正片删减部分的补全，《鹤唳华亭》也同样被观众认为正片结尾仓促，不符合剧情进展逻辑，部分剧情伏笔未能收回。从观众的评价来看，《别云间》的评价要比《鹤唳华亭》的正片更高，一方面因为相较于正片，番外《别云间》本身的剪辑节奏更为明快的、简洁。但另一方面，《别云间》的观众群体会相对而言比较集中于《鹤唳华亭》的“剧粉”，对于这部剧比较认可或者看完了大结局仍然心中抱有遗憾、期待有后续的观众会更为关注这部隔了八个月突然上线的《别云间》（扬子晚报评）。
《别云间》展现古建筑、礼仪、饮食和生活习俗制作精良的古装剧层出不穷，不仅掀起了我国古装剧的新一轮审美潮流，还对我国古代传统文化的大众传播与知识科普起到正面作用。该剧，从视觉、听觉、味觉等角度，对北宋服饰冠冕、宋朝名画艺术作品、宫廷雅乐、江南菜系佳肴、宴饮游戏投壶、“樱桃煎”蜜饯小食、北宋七十二酒楼之首的矾楼场景等大量历史文化符号细节进行打造，力求全方位呈现宋代美学体系（艺术理论学博士后，北京师范大学艺术与传媒学院讲师陈亦水评）。