内蒙古大学南校区是内蒙古大学两个主要校区之一，位于呼和浩特市玉泉区，西临昭君路，北依滨河南路，东侧为锡林南路，投资9.16亿元人民币，可容纳12000人，总面积1283亩。文学与新闻传播学院、历史与旅游文化学院、哲学学院、法学院、外国语学院、公共管理学院、生命科学学院、交通学院已入驻该校区，内蒙古艺术学院的部分专业（播音与主持艺术、表演、音乐剧、二人台等）在该校区内（艺术楼）授课。

内蒙古大学南校区地处呼和浩特市南郊，这里环境优美，既远离了城市的喧嚣，又不脱离市区的繁华。内蒙古大学南校区图书馆、体育馆、学生活动中心等设施一应俱全；食堂设有清真餐厅，可以方便各种需求的同学；宿舍有4人间（通常研究生为4人间），也有6人间（根据实际情况调配），上面是学生床铺，下面是属于学生的私人空间，有书架、衣柜、电脑桌等，每个宿舍都有阳台，并配有开放式的盥洗室。南校区的教学设备亦很先进，每个教室都配有多媒体教学设备等。国家动物转基因技术研究中心大楼也已正式完工，南校区面积也因此扩大。

内蒙古大学南校区的主要建筑物，高12层。内有学生电梯4处，教师电梯2处。其中教师电梯在非上下课时段向学生开放。教师电梯可从1楼到12楼每层都可停，学生电梯从2楼到6楼不可停。

主楼1至7层为上课用教室，8至12楼为各学院办公用楼（含实验室、会议厅等）。晚上，主楼一至五层开放至10点，供学生自习。

艺术楼位于校区校前广场东侧，与西侧的交通楼相对。总建筑面积：55055平方米。主体为4层，局部6层，高22米。总体布局将主要教学用房均东西向排列，在南北向以通廊相连，从而形成了多个院落相组合的布局，各部分既相对独立，又可互相连通。建筑主入口设于用地中部西侧。通过一个由环形密柱围廊所环绕的直径达50米的圆形广场，可分别进入美术系、音乐系、舞蹈系的教学区，从柱廊起点处的室外楼梯向上也可以直接进入各部分的二层大厅和艺术设计系教学区。圆形广场纯净的空间形状和柱廊的优美韵律营造了一种神秘的艺术气氛。（艺术楼现在也供内蒙古艺术学院的学生上课）

交通楼位于校区校前广场西侧，共5层，总建筑面积约30135平方米。主要功能为教学用房和实验室。最大程度地满足本科土建类、机械类、交通运输类三个专业实验室对楼层和空间功能的要求。

对于整个校园环境来说，交通学院与艺术楼、教学主楼共同围合出了整个校园主入口广场。在总体空间布局上，采取院落式布局。建筑主体呈“E”型布置于校前广场一侧，而各专业噪声大、对层高有特殊要求的厂房式实验室独立设置于用地西侧，用架空连廊与主体相连。这样的布局不仅削减了建筑庞大的体量，平面功能较为合理，而且每一个专业都有了自己独立出入口，围合出了内院空间。E字型南北向体量的一层架空，方便人流出入的同时，也实现了内院空间和前广场空间的联系与交流，丰富了广场的空间层次。

内蒙古大学实验动物研究中心-国家动物转基因技术研究中心作为我国重要的生物技术育种工作的条件建设项目，受到了国家和地方政府的高度重视和大力支持。经过近两年的建设，研究中心已经形成了集基因工程、细胞工程、胚胎生物工程、基因修饰工程、家畜育种、生物安全评价等多学科方向、高科技于一体的国际现代化生物技术研发平台。国家动物转基因技术研究中心的成立，标志着我国动物生物技术育种条件建设又上了一个新的台阶。

内蒙古大学图书馆（南校区），图书馆是南校区的一栋标志性建筑，也是学生自习的首选之地。一楼有各类、各时期的报纸杂志。二楼有社会科学类、文学类（含蒙文）阅览室。另外，三楼是外文阅览室、电子阅览室，四楼是图书基藏室以及各学院资料室。五楼是办公用楼。此外，图书馆还具有学术交流和研究的功能。图书馆在每周四下午闭馆。晚上开放至10点，供学生自习或阅览。

学生活动中心

南校区地处城市郊区，学生活动中心就成为了在这样地理位置的一个特殊产物。学生活动中心共三层。一楼为大学生创新创业中心，北侧还有洗浴中心在内的生活服务区。二楼、三楼为学生活动场所、教工之家、校团委及各学生组织办公场所。学生、社团可在二楼打羽毛球、跳舞、聊天、开会、举办晚会等；学校资助管理中心、社团联合会均在二楼办公；学校团委（学工处）、学生联合会、社区团工委、旗帜网站等位于三楼。

学生公寓宿舍区

南区共九座公寓楼，每座公寓楼下配备健身器材若干，地下室有台球厅等。学生可以在这里健身娱乐，所以公寓楼也成为学生较喜欢的休闲场所之一。

体育馆及各球场

南校区室外有两处计十余个篮球场地、三个网球场、两个排球场和一个足球场。

体育馆共三层，一楼为室内篮球场、健美操馆和武术馆；二楼为健身馆、乒乓球馆；三楼为羽毛球馆。设施完备，深受同学们喜爱。

内蒙古大学南校区共有 九栋宿舍楼，除9号楼为5层之外，其余均为6层。宿舍设计较为舒适，有一个开放式的盥洗室和一个阳台。大多数为6人间，上床下铺。少部分宿舍为上下铺（部分研究生及艺术生）。

内蒙古大学南校区位于市区南部，北侧靠近小黑河，较为偏远，但周围公交车较多，可在西侧创业学院站点乘坐1路车（途经通达南站，海亮广场，火车站）或62路（途经内蒙古大学北校区，嘉茂购物中心，九州商厦）到市区，东门恒泰圣都站点也可乘坐26路（途经嘉茂购物中心，海亮广场）进入市区，此外还有白天定时的校车到达内蒙古大学北校区。还可乘坐地铁2号线。